STRING API
Die STRING-Protein-Protein-Interaktionsdatenbank als API – das kuratierte und vorhergesagte Netzwerk funktionaler Assoziationen zwischen Proteinen, unterstützt durch die offizielle STRING API. Lösen Sie Gen- oder Proteinnamen in STRING-Identifikatoren mit Annotationen auf; erhalten Sie die wichtigsten Interaktionspartner eines Proteins mit einem kombinierten Konfidenzwert und kanalspezifischen Evidenzen (experimentell, kuratierte Datenbanken, Co-Expression, Text-Mining, Genfusion, Nachbarschaft und Co-Occurrence); erstellen Sie das Interaktionsnetzwerk zwischen einer Gruppe von Proteinen als bewertete Kanten; führen Sie eine funktionale Anreicherung eines Gensets über Gene Ontology, KEGG, Reactome, Pfam, InterPro und mehr mit p-Werten und False-Discovery-Raten durch; und bewerten Sie die Homologie zwischen Proteinen. Deckt über 12.000 Organismen ab (Standard Mensch, NCBI-Taxon 9606). Ideal für Systembiologie- und Netzwerkbiologie-Pipelines, Gen-Set- und Pathway-Analysen, Drug-Target- und Krankheitsgen-Forschung sowie Bioinformatik-Dashboards.
api.oanor.com/string-api