InterPro API
Proteinfamilien, Domänen und funktionelle Stellen als API, unterstützt durch die EBI InterPro-Datenbank. InterPro klassifiziert Proteine in Familien und identifiziert die Domänen, Wiederholungen und wichtigen Stellen, die sie enthalten, indem es die prädiktiven Signaturen vieler Mitgliedsdatenbanken (Pfam, SMART, PROSITE, CDD, PANTHER, SUPERFAMILY, NCBIfam und mehr) in einer einzigen integrierten Ressource zusammenfasst. Suchen Sie einen InterPro-Eintrag – eine Familie, Domäne, Wiederholung, konservierte/bindende/aktive Stelle oder posttranslationale Modifikation – mit seiner Beschreibung, Gene-Ontology-Begriffen und den Signaturen der Mitgliedsdatenbanken, die ihn definieren; durchsuchen Sie Einträge nach Name und Typ; lesen Sie die Metadaten eines Proteins; und, am nützlichsten, listen Sie die InterPro-Einträge auf, die auf einem Protein gefunden werden, zusammen mit ihren Start- und Endpositionen, sodass Sie die Domänenarchitektur eines Proteins sehen können. Ideal für Proteinannotation und Funktionsvorhersage, vergleichende Genomik, strukturbiologische und bioinformatische Pipelines sowie Forschungs- und Lehrmittel. Eintrags-IDs sind IPR gefolgt von sechs Ziffern; Protein-IDs sind UniProt-Zugriffsnummern. Daten von EMBL-EBI.
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