API Θερμοκρασίας Τήξης DNA
Μαθηματικά DNA-ολιγονουκλεοτιδίων και PCR-εκκινητών ως API, υπολογιζόμενα τοπικά και ντετερμινιστικά. Το τελικό σημείο tm υπολογίζει τη θερμοκρασία τήξης μιας αλληλουχίας εκκινητή με τρεις τρόπους: τον κανόνα Wallace 2·(A+T) + 4·(G+C) για μικρά ολιγονουκλεοτίδια έως 13 νουκλεοτίδια, τον τύπο GC Marmur–Wallace 64.9 + 41·(nGC − 16.4)/N για μεγαλύτερα, και τον προσαρμοσμένο σε άλας 81.5 + 0.41·%GC − 675/N + 16.6·log10[Na+] για δεδομένη συγκέντρωση νατρίου, και προτείνει τη σωστή μέθοδο για το μήκος — ένα οκταμερές ATGCATGC τήκεται στους 24 °C κατά Wallace, ένας εκκινητής 20 βάσεων με 50 % GC στους περίπου 51.8 °C κατά Marmur. Το τελικό σημείο gc-content αναφέρει τα ποσοστά GC και AT, τις μετρήσεις ανά βάση και το μοριακό βάρος μονής αλυσίδας. Το τελικό σημείο reverse-complement επιστρέφει το συμπλήρωμα, την αντιστροφή και το αντίστροφο συμπλήρωμα μιας αλυσίδας. Οι αλληλουχίες χρησιμοποιούν A/C/G/T (χωρίς διάκριση πεζών-κεφαλαίων, τα κενά αγνοούνται) και [Na+] σε mol/L. Όλα υπολογίζονται τοπικά και ντετερμινιστικά, επομένως είναι άμεσα και ιδιωτικά. Ιδανικό για προγραμματιστές εφαρμογών μοριακής βιολογίας, βιοτεχνολογίας, PCR, σχεδιασμού εκκινητών, βιοπληροφορικής και εργαστηριακού αυτοματισμού, υπολογιστές ολιγονουκλεοτιδίων και εκκινητών, και λογισμικό LIMS. Τύποι εκτίμησης για σχεδιασμό εκκινητών, όχι υποκατάστατο της θερμοδυναμικής πλησιέστερου γείτονα. Καθαρός τοπικός υπολογισμός — χωρίς κλειδί, χωρίς υπηρεσία τρίτου, άμεσο. Ζωντανό, τίποτα δεν αποθηκεύεται. 3 τελικά σημεία. Αυτή είναι θερμοκρασία τήξης ολιγονουκλεοτιδίων· για συχνότητες αλληλόμορφων πληθυσμιακής γενετικής χρησιμοποιήστε ένα API γενετικής.
api.oanor.com/dnamelt-api
