#rfam

Η βάση δεδομένων Rfam οικογενειών μη-κωδικοποιητικών RNA ως API, με την υποστήριξη του EMBL-EBI. Το Rfam ομαδοποιεί λειτουργικά RNA που μοιράζονται μια κοινή εξελικτική προέλευση σε οικογένειες, κάθε μία από τις οποίες μοντελοποιείται από ένα μοντέλο συνδιακύμανσης που βασίζεται σε μια επιμελημένη στοίχιση σπόρων και δευτεροταγή δομή. Αναζητήστε τις οικογένειες με όνομα, περιγραφή ή τύπο RNA — ριβοδιακόπτες και άλλα ρυθμιστικά στοιχεία cis, ριβοένζυμα, οικογένειες microRNA, ριβοσωμικά RNA, μεταφορικά RNA, μικρά πυρηνικά και μικρά πυρηνιδιακά RNA, μακρά μη-κωδικοποιητικά RNA και άμεσες επαναλήψεις CRISPR — λαμβάνοντας για κάθε οικογένεια το αναγνωριστικό Rfam, το όνομα, την περιγραφή, τον τύπο RNA και τους επιμελητές· διαβάστε την πλήρη εγγραφή μιας οικογένειας συμπεριλαμβανομένης της περιγραφής της, της ταξινόμησης τύπου RNA, των επιμελητών που την κατασκεύασαν, του αριθμού αλληλουχιών στις πλήρεις και σπορ στοιχίσεις, της πηγής δομής, του σχολίου του επιμελητή, της ομάδας (clan) στην οποία ανήκει και της έκδοσης Rfam· και περιηγηθείτε στις οικογένειες ανά κατηγορία RNA. Ιδανικό για βιολογία RNA, βιοπληροφορικές ροές εργασίας, σχολιασμό μη-κωδικοποιητικών RNA, συγκριτική γονιδιωματική και διδασκαλία. Τα αναγνωριστικά οικογενειών μοιάζουν με RF00005 (μεταφορικό RNA). Δεδομένα από το EMBL-EBI Rfam. Για οικογένειες και τομείς πρωτεϊνών δείτε το API InterPro, για πρωτεϊνικές αλληλουχίες το UniProt, για σύνολα δεδομένων πρωτεομικής το PRIDE και για μεταβολομική το MetaboLights.

api.oanor.com/rfam-api