#metabolism

La base de datos molecular KEGG como API, impulsada por el servicio oficial KEGG REST. KEGG (la Enciclopedia de Genes y Genomas de Kioto) vincula genomas, química y enfermedades. Obtén cualquier entrada de KEGG analizada a JSON: un compuesto metabólico, grupo de ortología KEGG (KO), enzima (número EC), reacción, módulo, fármaco, enfermedad, glicano, gen o mapa de vía; busca en cualquier base de datos de KEGG por nombre; lista las entradas de una base de datos; enlaza entradas entre bases de datos (un gen a sus vías, una vía a sus compuestos, una enzima a sus reacciones); y convierte identificadores de KEGG hacia y desde espacios de nombres externos (NCBI Gene/Protein, UniProt, ChEBI, PubChem). Ideal para pipelines de biología de sistemas y metabolómica, mapeo de enzimas y ortología, investigación de fármacos y enfermedades, anotación de genes a vías y conversión de identificadores en bioinformática. Los ids de KEGG tienen prefijo de letra (C compuesto, K ortología, D fármaco, H enfermedad, M módulo, R reacción, G glicano) o están codificados por organismo (hsa humano, eco E. coli).

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La base de conocimiento de rutas de Reactome como una API — la base de datos abierta y revisada por pares de rutas y reacciones biológicas, impulsada por el Reactome ContentService oficial. Busque en el archivo curado de rutas, reacciones y moléculas; lea cualquier entidad por su ID estable de Reactome (una ruta, reacción, complejo o proteína: nombre, tipo, especie, compartimentos, resumen y bandera de enfermedad); enumere los eventos (sub-rutas y reacciones) contenidos en una ruta; enumere las moléculas que participan en una ruta o reacción con sus identificadores de referencia; obtenga las rutas de nivel superior para cualquier organismo modelo; asigne una proteína UniProt a las rutas en las que participa; y enumere las especies compatibles. Cubre humanos y más de 15 organismos modelo en metabolismo, transducción de señales, ciclo celular, sistema inmunológico, enfermedades y más. Ideal para pipelines de biología de sistemas y bioinformática, herramientas de enriquecimiento de rutas y dianas farmacológicas, aplicaciones de investigación biomédica, recursos educativos y chatbots de ciencias de la vida.

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