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API · /chembl-api

API ChEMBL

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La base de données ChEMBL de molécules bioactives sous forme d'API — la base de connaissances manuellement organisée de l'EBI sur les composés de type médicamenteux et leur activité biologique, alimentée par l'API officielle des données ChEMBL. Recherchez un composé par son identifiant ChEMBL pour sa phase de développement, sa structure chimique (SMILES, InChIKey), sa formule moléculaire et son poids, ses propriétés calculées (ALogP, surface polaire, donneurs/accepteurs de liaisons hydrogène, violations de la règle de cinq, QED de type médicament) et ses synonymes ; recherchez des composés par nom ; lisez une cible biologique avec son organisme et ses composants protéiques UniProt ; listez les mécanismes d'action d'un médicament ; listez ses indications approuvées et expérimentales (termes MeSH et EFO avec phase de développement) ; et extrayez ses bioactivités mesurées (IC50, Ki, EC50, puissance…) avec valeurs, unités, scores pChEMBL, essais et cibles. Idéal pour les pipelines de découverte de médicaments et de chémoinformatique, les outils de chimie médicinale et de pharmacologie, la recherche d'identification de cibles et de SAR, et les applications en sciences de la vie.

#chembl #drug-discovery #cheminformatics #molecules #bioactivity #pharmacology #life-sciences
api.oanor.com/chembl-api
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/api/chembl-api/openapi.json
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Autres APIs avec des balises qui se chevauchent.

API Open Targets

Associations cible médicamenteuse–maladie sous forme d'API, propulsées par la plateforme Open Targets. Open Targets intègre la génétique humaine, la génomique, la transcriptomique, les médicaments connus, les modèles animaux et la littérature scientifique pour évaluer systématiquement la force de l'association entre une cible (gène/protéine) et une maladie — les preuves qui sous-tendent la découverte moderne de médicaments. Recherchez parmi les cibles, les maladies et les médicaments ; consultez une cible pour son symbole approuvé, son biotype, sa fonction, sa localisation génomique et ses identifiants UniProt ainsi que les maladies auxquelles elle est le plus fortement associée et leurs scores d'association globaux ; consultez une maladie pour sa description, ses domaines thérapeutiques et ses principales cibles associées avec scores ; et consultez un médicament pour sa modalité, son stade clinique maximal, ses noms commerciaux, ses synonymes et ses mécanismes d'action. Idéal pour les pipelines de découverte de médicaments et d'identification de cibles, la recherche par domaine thérapeutique, la science des données biomédicales et les outils de veille pharmaceutique. Les identifiants de cibles sont les identifiants de gènes Ensembl, les identifiants de maladies sont les identifiants EFO/MONDO/Orphanet, les identifiants de médicaments sont les identifiants ChEMBL. Les données sont ouvertes (CC0).

api.oanor.com/opentargets-api

API Chimie

Données de composés chimiques sous forme d'API, propulsées par NIH PubChem (>100 millions de composés). Recherchez n'importe quel composé par nom commun, CID PubChem ou SMILES et obtenez sa formule moléculaire, sa masse moléculaire et exacte, son nom IUPAC, son SMILES canonique, son InChI et InChIKey, ainsi que ses propriétés physicochimiques (XLogP, TPSA, charge formelle, nombre de donneurs/accepteurs de liaisons hydrogène, liaisons rotatives, nombre d'atomes lourds). Listez les synonymes d'un composé et les noms commerciaux/enregistrés, ou résolvez un nom en CIDs PubChem. Idéal pour la chémoinformatique, les logiciels de laboratoire, l'éducation, les outils de découverte de médicaments et les pipelines de données scientifiques.

api.oanor.com/chemistry-api

API BioSamples

BioSamples en tant qu'API, propulsé par EMBL-EBI — la base de données qui stocke et lie les métadonnées des échantillons biologiques, les spécimens physiques derrière les expériences biologiques. Un échantillon dans BioSamples porte un accession stable (tel que SAMEA3231268) et un riche ensemble de caractéristiques — organisme, tissu ou partie d'organisme, type cellulaire, sexe, maladie, stade de développement, souche et tout attribut fourni par le soumissionnaire — et est référencé par d'autres archives de l'EBI, notamment l'European Nucleotide Archive (ENA), ArrayExpress et PRIDE. /v1/search?q=liver recherche des échantillons par texte libre et renvoie l'accession, le nom, l'organisme et la date de publication de chaque correspondance. /v1/sample?id=SAMEA3231268 renvoie les métadonnées d'un échantillon — son accession, son nom, son identifiant taxonomique NCBI, son organisme, ses dates de publication et de mise à jour, le nombre de relations avec d'autres échantillons, et ses caractéristiques aplaties en une carte clé→valeur propre. Les accessions ressemblent à SAMEA…, SAMN… ou SAMD… ; obtenez-en un à partir du point de terminaison de recherche. Idéal pour l'intégration de données en sciences de la vie, le suivi des échantillons, l'harmonisation des métadonnées et la liaison des données de séquençage ou d'expression à leur spécimen source. Données provenant d'EMBL-EBI BioSamples (publiques). Il s'agit d'un registre de métadonnées d'échantillons biologiques — distinct des bases de données d'études (BioStudies), de séquences (ENA), de variants (ClinVar) et de structures.

api.oanor.com/biosamples-api

API BioStudies

BioStudies en tant qu'API, propulsé par EMBL-EBI — la base de données qui contient les descriptions d'études biologiques et relie leurs données à travers les ressources de l'EBI, y compris l'imagerie (BioImage Archive), la génomique fonctionnelle (ArrayExpress), la protéomique et la littérature (Europe PMC). Chaque étude possède un identifiant, un titre et un résumé, la collection à laquelle elle appartient et des liens vers ses données sous-jacentes et ses publications. /v1/search?query=covid recherche les études et renvoie l'identifiant de chaque correspondance (par exemple S-EPMC8017430), le titre, l'auteur, le type d'étude, la date de publication et les comptes de liens/fichiers. /v1/study?id=S-EPMC8017430 renvoie les métadonnées d'une étude — son identifiant, la collection à laquelle elle appartient (telle que EuropePMC, ArrayExpress ou BioImages), le titre, le résumé, la date de publication, les auteurs et le nombre de ressources liées. Les identifiants ressemblent à S-EPMC8017430 ou S-BSST123 ; obtenez-en un à partir du point de terminaison de recherche. Idéal pour la découverte de données de recherche, la liaison de la littérature à ses ensembles de données sous-jacents, les revues systématiques et les outils de reproductibilité. Données provenant d'EMBL-EBI BioStudies (publiques). Il s'agit d'un index de métadonnées d'études et d'ensembles de données — distinct des bases de données de séquences (UniProt, ENA), de structures (PDB, EMDB), de variants (ClinVar) et d'ontologies.

api.oanor.com/biostudies-api

Questions fréquentes

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Comment obtenir une clé API pour API ChEMBL ?
Inscris-toi gratuitement sur oanor.com, génère une clé API depuis le tableau de bord développeur et appelle API ChEMBL avec l'en-tête x-oanor-key. Aucune carte bancaire requise pour le forfait gratuit.
Quelle est la limite de débit de API ChEMBL ?
Le forfait gratuit permet 1 requête par seconde. Les forfaits payants montent jusqu'à 50 requêtes par seconde sur le palier Mega. Les limites strictes renvoient HTTP 429 au-delà du quota — sans frais surprises.
Combien coûte API ChEMBL ?
API ChEMBL dispose d'un forfait gratuit avec 100 appels / mois. Les forfaits payants commencent à €7.30 / mois avec des quotas plus élevés et des limites de débit plus rapides.
Puis-je résilier mon abonnement à tout moment ?
Oui. Les abonnements sont facturés mensuellement et tu peux résilier à tout moment depuis le tableau de bord de facturation. Aucun engagement à long terme ni frais de résiliation.
API ChEMBL est-il conforme au RGPD ?
Toutes les requêtes vers API ChEMBL transitent par notre passerelle européenne. Ta clé API upstream ne quitte jamais notre serveur et aucune donnée personnelle n'est partagée avec le fournisseur upstream au-delà de la requête envoyée.

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Extraits de code

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curl https://api.oanor.com/chembl-api/SOME_PATH \
  -H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/chembl-api/SOME_PATH", {
  headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/chembl-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
    "https://api.oanor.com/chembl-api/SOME_PATH",
    headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())

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