#biosamples

BioSamples en tant qu'API, propulsé par EMBL-EBI — la base de données qui stocke et lie les métadonnées des échantillons biologiques, les spécimens physiques derrière les expériences biologiques. Un échantillon dans BioSamples porte un accession stable (tel que SAMEA3231268) et un riche ensemble de caractéristiques — organisme, tissu ou partie d'organisme, type cellulaire, sexe, maladie, stade de développement, souche et tout attribut fourni par le soumissionnaire — et est référencé par d'autres archives de l'EBI, notamment l'European Nucleotide Archive (ENA), ArrayExpress et PRIDE. /v1/search?q=liver recherche des échantillons par texte libre et renvoie l'accession, le nom, l'organisme et la date de publication de chaque correspondance. /v1/sample?id=SAMEA3231268 renvoie les métadonnées d'un échantillon — son accession, son nom, son identifiant taxonomique NCBI, son organisme, ses dates de publication et de mise à jour, le nombre de relations avec d'autres échantillons, et ses caractéristiques aplaties en une carte clé→valeur propre. Les accessions ressemblent à SAMEA…, SAMN… ou SAMD… ; obtenez-en un à partir du point de terminaison de recherche. Idéal pour l'intégration de données en sciences de la vie, le suivi des échantillons, l'harmonisation des métadonnées et la liaison des données de séquençage ou d'expression à leur spécimen source. Données provenant d'EMBL-EBI BioSamples (publiques). Il s'agit d'un registre de métadonnées d'échantillons biologiques — distinct des bases de données d'études (BioStudies), de séquences (ENA), de variants (ClinVar) et de structures.

api.oanor.com/biosamples-api