#emdb

La Banque de données de microscopie électronique (EMDB) en tant qu'API, propulsée par EMBL-EBI — l'archive publique de cartes de densité tridimensionnelles de microscopie électronique de protéines, acides nucléiques et grands complexes macromoléculaires. EMDB est l'équivalent en microscopie électronique de la Protein Data Bank, contenant des cartes résolues par cryo-ME à particule unique, tomographie électronique et cristallographie électronique, la technique derrière la récente « révolution de la résolution » en biologie structurale. /v1/search?q=ribosome recherche dans l'archive et renvoie pour chaque entrée correspondante son identifiant EMDB (par exemple EMD-1010), son titre, la méthode de microscopie électronique et la résolution en ångströms. /v1/entry?id=EMD-1010 renvoie les métadonnées d'une entrée — son titre, la méthode ME (particule unique, tomographie, …), l'état d'agrégation, la résolution, l'échantillon biologique étudié, les mots-clés de classification, les dates de dépôt, de publication de la carte et de dernière mise à jour, ainsi que les auteurs du dépôt. Les identifiants EMDB ressemblent à EMD-1010, et vous pouvez passer uniquement le numéro. Idéal pour les outils de biologie structurale et de cryo-ME, les applications de comparaison de structures et de visualisation, et l'éducation. Données provenant d'EMBL-EBI EMDB (domaine public). Il s'agit de l'archive des cartes expérimentales de microscopie électronique — distincte des structures de coordonnées atomiques (PDB), des structures prédites (AlphaFold) et des bases de données de séquences protéiques (UniProt).

api.oanor.com/emdb-api