API de température de fusion de l'ADN
Calculs d'ADN-oligo et d'amorce PCR sous forme d'API, calculés localement et de manière déterministe. Le point de terminaison tm calcule la température de fusion d'une séquence d'amorce de trois manières : la règle de Wallace 2·(A+T) + 4·(G+C) pour les oligos courts jusqu'à 13 nt, la formule GC de Marmur–Wallace 64.9 + 41·(nGC − 16.4)/N pour les plus longs, et la formule ajustée au sel 81.5 + 0.41·%GC − 675/N + 16.6·log10[Na+] pour une concentration de sodium donnée, et recommande la méthode appropriée pour la longueur — un ATGCATGC de huit bases fond à 24 °C selon Wallace, une amorce de 20 bases à 50 % de GC à environ 51.8 °C selon Marmur. Le point de terminaison gc-content rapporte les pourcentages GC et AT, les comptes par base et le poids moléculaire simple brin. Le point de terminaison reverse-complement renvoie le complément, l'inverse et le complément inverse d'un brin. Les séquences utilisent A/C/G/T (insensible à la casse, les espaces ignorés) et [Na+] est en mol/L. Tout est calculé localement et de manière déterministe, donc instantané et privé. Idéal pour les développeurs d'applications en biologie moléculaire, biotechnologie, PCR, conception d'amorces, bioinformatique et automatisation de laboratoire, les calculateurs d'oligo et d'amorce, et les logiciels LIMS. Formules d'estimation pour la conception d'amorces, ne remplace pas la thermodynamique des plus proches voisins. Calcul local pur — pas de clé, pas de service tiers, instantané. En direct, rien n'est stocké. 3 points de terminaison. Ceci est la température de fusion des oligos ; pour les fréquences alléliques en génétique des populations, utilisez une API de génétique.
api.oanor.com/dnamelt-api
