Cellosaurus API
Cellosaurus als API, aangedreven door het SIB Swiss Institute of Bioinformatics — de referentie-encyclopedie van cellijnen die in biomedisch onderzoek worden gebruikt. Met meer dan 150.000 vermeldingen, variërend van kankercellijnen, hybridoma's, geïnduceerde pluripotente stamcellen en cellijnen van honderden soorten, is Cellosaurus de gezaghebbende catalogus die onderzoekers gebruiken om de cellijnen achter gepubliceerde experimenten te identificeren en te valideren. Doorzoek de cellijnen op naam of trefwoord en verkrijg de Cellosaurus-toegang (CVCL_…), naam, categorie, soort en ziekte van elke lijn; en lees het volledige record van een cellijn — de naam en synoniemen, categorie (bijv. kankercellijn, hybridoma, stamcel), soort met NCBI-taxonomie-id, geslacht, leeftijd, de ziekte waarvan het is afgeleid met NCIt/ontologie-identificatoren, het weefsel of anatomische plaats van herkomst, de oudercellijn en het aantal afgeleide dochtercellijnen, het aantal literatuurverwijzingen en de vele kruisverwijzingen (naar ATCC, DSMZ, ECACC, Wikidata en meer), relevante webpagina's, en — cruciaal voor reproduceerbaarheid van onderzoek — of de lijn is gemarkeerd als PROBLEMATISCH, wat betekent dat deze verkeerd is geïdentificeerd of kruisbesmet is, samen met de toelichtende notities. Ideaal voor laboratoriumkwaliteitscontrole en cellijnauthenticatie, biomedisch en kankeronderzoek, gegevenscuratie en reproduceerbaarheidscontroles. Toegangen zien eruit als CVCL_0030 (HeLa). Gegevens van Cellosaurus (CC-BY 4.0).
api.oanor.com/cellosaurus-api
