#crystallography

Kristalstructuren als API — aangedreven door de Crystallography Open Database (COD), de open, publiek-domein verzameling van meer dan 500.000 kristalstructuren van organische, anorganische, metaal-organische verbindingen en mineralen. Doorzoek de database op chemische formule (elke standaard schrijfwijze — TiO2, Al2O3, H2O — wordt automatisch genormaliseerd) of op vrije tekst over mineraalnamen, titels en opmerkingen, en bekijk vervolgens elke structuur om de volledige kristallografische gegevens te krijgen: chemische en celformule, ruimtegroep (Hermann-Mauguin en Hall), de volledige eenheidscel (a, b, c, alfa, bèta, gamma en volume), de bronpublicatie (titel, auteurs, tijdschrift, jaar, DOI) en een link naar het CIF-bestand. Van kwarts, calciet en diamant tot anatase, korund en diopsiet, het is ideaal voor materiaalkunde, vastestofchemie, mineralogie, kristallografie onderwijs en onderzoekstools. Dit is een kristalstructuur- en materialendatabase — verschillend van molecuul-eigenschap (chemie / PubChem) en eiwitstructuur (PDB) databases. Open data van de Crystallography Open Database (CC0 / publiek domein).

api.oanor.com/cod-api

De RCSB Protein Data Bank als API — 3D-macromoleculaire structuren van eiwitten, nucleïnezuren en complexen, aangedreven door de officiële RCSB PDB-gegevens en zoekdiensten. Haal een structuurinvoer op met de 4-karakter PDB-id voor de titel, experimentele methode (röntgen, cryo-EM, NMR), resolutie, trefwoorden, deponerings- en releasedatums, auteurs, primaire citatie en entiteit- & assemblage-aantallen; voer een full-text zoekopdracht uit over het hele archief die overeenkomende PDB-id's en het totale aantal hits retourneert; lees een polymeer-entiteit voor de eiwit- of nucleïnezuurnaam, één-letter sequentie, lengte, bronorganisme, ketens en gekoppelde UniProt-id's; lees een biologische assemblage voor de oligomere toestand, symmetrie en keten- & atoomtellingen; vermeld de liganden die in een structuur zijn gebonden met hun component-id's en namen; en zoek een chemische component (ligand) op code voor de formule, gewicht, SMILES en InChIKey. Ideaal voor structurele biologie en geneesmiddelenontdekkingstools, moleculaire viewers, bioinformatica-pijplijnen, onderwijsapps en onderzoeksdashboards.

api.oanor.com/pdb-api