InterPro API
Proteïnefamilies, domeinen en functionele sites als een API, aangedreven door de EBI InterPro-database. InterPro classificeert eiwitten in families en identificeert de domeinen, herhalingen en belangrijke sites die ze bevatten, door de voorspellende handtekeningen van vele lid-databases (Pfam, SMART, PROSITE, CDD, PANTHER, SUPERFAMILY, NCBIfam en meer) te combineren in één geïntegreerde bron. Zoek een InterPro-entry op — een familie, domein, herhaling, geconserveerde/bindende/actieve site of post-translationele modificatie — met de beschrijving, Gene Ontology-termen en de lid-database handtekeningen die het definiëren; doorzoek entries op naam en type; lees de metadata van een eiwit; en, het meest nuttig, toon de InterPro-entries die op een eiwit worden gevonden samen met hun start-eindposities, zodat je de domeinarchitectuur van een eiwit kunt zien. Ideaal voor eiwitannotatie en functievoorspelling, vergelijkende genomica, structurele biologie en bioinformatica-pijplijnen, en onderzoeks- en onderwijs-tools. Entry-id's zijn IPR gevolgd door zes cijfers; eiwit-id's zijn UniProt-toegangsnummers. Gegevens van EMBL-EBI.
api.oanor.com/interpro-api
