BioSamples API
BioSamples als API, betrieben von EMBL-EBI – die Datenbank, die die Metadaten biologischer Proben speichert und verknüpft, die physischen Exemplare hinter biologischen Experimenten. Eine Probe in BioSamples trägt eine stabile Zugangsnummer (wie SAMEA3231268) und eine umfangreiche Reihe von Merkmalen – Organismus, Gewebe oder Organbestandteil, Zelltyp, Geschlecht, Krankheit, Entwicklungsstadium, Stamm und alle vom Einreicher bereitgestellten Attribute – und wird von anderen EBI-Archiven referenziert, darunter das European Nucleotide Archive (ENA), ArrayExpress und PRIDE. /v1/search?q=liver durchsucht Proben nach Freitext und gibt für jede Übereinstimmung die Zugangsnummer, den Namen, den Organismus und das Veröffentlichungsdatum zurück. /v1/sample?id=SAMEA3231268 gibt die Metadaten einer Probe zurück – ihre Zugangsnummer, ihren Namen, die NCBI-Taxon-ID, den Organismus, das Veröffentlichungs- und Aktualisierungsdatum, die Anzahl der Beziehungen zu anderen Proben und ihre Merkmale, reduziert auf eine saubere Schlüssel→Wert-Zuordnung. Zugangsnummern sehen aus wie SAMEA…, SAMN… oder SAMD…; erhalten Sie eine vom Such-Endpunkt. Ideal für die Integration lebenswissenschaftlicher Daten, Probenverfolgung, Metadatenharmonisierung und die Verknüpfung von Sequenzierungs- oder Expressionsdaten mit ihrem Ursprungsexemplar. Daten von EMBL-EBI BioSamples (öffentlich). Dies ist ein Register für biologische Probenmetadaten – zu unterscheiden von Studien- (BioStudies), Sequenz- (ENA), Varianten- (ClinVar) und Strukturdatenbanken.
api.oanor.com/biosamples-api
