#mass-spectrometry

Το MetaboLights ως API, με την υποστήριξη του EMBL-EBI — το κορυφαίο ανοιχτό αποθετήριο στον κόσμο για πειράματα μεταβολομικής (φασματοσκοπία NMR και φασματομετρία μάζας) και αδελφός πόρος του PRIDE για πρωτεομική. Αναζητήστε τις δημόσιες μελέτες μεταβολομικής με λέξη-κλειδί (επιστρέφοντας τον κωδικό πρόσβασης, τον τίτλο, την περιγραφή και τον οργανισμό κάθε μελέτης)· διαβάστε τα πλήρη μεταδεδομένα μιας μελέτης, συμπεριλαμβανομένης της περίληψης, της κατάστασης, των ημερομηνιών υποβολής και δημοσίευσης, των περιγραφικών παραγόντων σχεδιασμού της μελέτης, των πειραματικών παραγόντων, των αναλυτικών δοκιμασιών με τον τύπο μέτρησης, την τεχνολογία και την πλατφόρμα τους, των συντελεστών και των ρόλων τους, των συνδεδεμένων δημοσιεύσεων με αναγνωριστικά DOI και PubMed, των υποβαλλόντων, του αριθμού δειγμάτων, της διεύθυνσης URL λήψης FTP και της άδειας δεδομένων· επιθεωρήστε την αναλυτική ροή εργασίας — κάθε πρωτόκολλο με το όνομα, τον τύπο, την περιγραφή και τις παραμέτρους του (συλλογή δειγμάτων, εκχύλιση, χρωματογραφία, φασματοσκοπία NMR/MS, μετασχηματισμός δεδομένων και ταυτοποίηση μεταβολιτών)· και καταγράψτε τους οργανισμούς και τα μέρη οργανισμών που μελετήθηκαν με τους όρους οντολογίας τους. Ιδανικό για έρευνα μεταβολομικής και συστημικής βιολογίας, επαναχρησιμοποίηση συνόλων δεδομένων και μετα-ανάλυση, βιοπληροφορικές αγωγούς και εργαλεία που ενσωματώνουν πειραματικές αποδείξεις. Οι κωδικοί πρόσβασης μελετών μοιάζουν με MTBLS1. Δεδομένα από το EMBL-EBI MetaboLights.

api.oanor.com/metabolights-api

Το αρχείο πρωτεομικής PRIDE ως API, που υποστηρίζεται από το EMBL-EBI PRIDE Archive — το μεγαλύτερο δημόσιο αποθετήριο δεδομένων πρωτεομικής φασματομετρίας μάζας στον κόσμο και ιδρυτικό μέλος του ProteomeXchange. Αναζητήστε δημόσια πειράματα πρωτεομικής με λέξη-κλειδί (επιστρέφοντας το accession, τον τίτλο, τους οργανισμούς, τις ασθένειες και τα όργανα κάθε έργου). Διαβάστε τα πλήρη μεταδεδομένα ενός έργου, συμπεριλαμβανομένων της περιγραφής, των λέξεων-κλειδιών, των οργανισμών και των μερών οργανισμών, των οργάνων φασματομετρίας μάζας, του λογισμικού, των ταυτοποιημένων τροποποιήσεων πρωτεϊνών, των πρωτοκόλλων επεξεργασίας δειγμάτων και δεδομένων, των υποβαλλόντων, των συνεργασιών και της συνδεδεμένης δημοσίευσης (DOI και PubMed). Καταγράψτε τα αρχεία δεδομένων ενός έργου με την κατηγορία, τη μορφή, το μέγεθος και έναν άμεσο σύνδεσμο λήψης. Εξερευνήστε πτυχές — τις ασθένειες, τους οργανισμούς, τα όργανα, τους τύπους πειραμάτων, το λογισμικό και τις χώρες που εκπροσωπούνται σε αντίστοιχα έργα — για ανακάλυψη. Ιδανικό για έρευνα πρωτεομικής και συστημικής βιολογίας, επαναχρησιμοποίηση συνόλων δεδομένων και μετα-ανάλυση, βιοπληροφορικές ροές εργασίας και εργαλεία που ενσωματώνουν πειραματικά δεδομένα. Τα accessions έργων μοιάζουν με PXD000001. Δεδομένα από EMBL-EBI.

api.oanor.com/pride-api