#mass-spectrometry

MetaboLights como API, impulsado por EMBL-EBI — el repositorio abierto más importante del mundo para experimentos de metabolómica (espectroscopia de RMN y espectrometría de masas) y un recurso hermano de PRIDE para proteómica. Busque estudios públicos de metabolómica por palabra clave (devolviendo el acceso, título, descripción y organismo de cada estudio); lea los metadatos completos de un estudio, incluido su resumen, estado, fechas de envío y publicación, descriptores de diseño del estudio, factores experimentales, los ensayos analíticos con su tipo de medición, tecnología y plataforma, los contribuyentes y sus roles, las publicaciones vinculadas con DOI e identificadores de PubMed, remitentes, recuento de muestras, URL de descarga FTP y licencia de datos; inspeccione el flujo de trabajo analítico — cada protocolo con su nombre, tipo, descripción y parámetros (recolección de muestras, extracción, cromatografía, espectroscopia de RMN/MS, transformación de datos e identificación de metabolitos); y enumere los organismos y partes de organismos estudiados con sus términos de ontología. Ideal para investigación en metabolómica y biología de sistemas, reutilización de conjuntos de datos y metaanálisis, tuberías de bioinformática y herramientas que integran evidencia experimental. Los accesos de estudio se ven como MTBLS1. Datos de EMBL-EBI MetaboLights.

api.oanor.com/metabolights-api

El archivo de proteómica PRIDE como una API, impulsado por el Archivo PRIDE de EMBL-EBI, el repositorio público más grande del mundo de datos de proteómica por espectrometría de masas y miembro fundador de ProteomeXchange. Busque experimentos públicos de proteómica por palabra clave (devolviendo el acceso, título, organismos, enfermedades e instrumentos de cada proyecto); lea los metadatos completos de un proyecto, incluida su descripción, palabras clave, organismos y partes de organismos, instrumentos de espectrometría de masas, software, las modificaciones de proteínas identificadas, protocolos de procesamiento de muestras y datos, remitentes, afiliaciones y la publicación vinculada (DOI y PubMed); enumere los archivos de datos de un proyecto con su categoría, formato, tamaño y un enlace de descarga directa; y explore facetas (las enfermedades, organismos, instrumentos, tipos de experimento, software y países representados en los proyectos coincidentes) para el descubrimiento. Ideal para investigación en proteómica y biología de sistemas, reutilización de conjuntos de datos y metaanálisis, tuberías de bioinformática y herramientas que integran evidencia experimental. Los accesos de proyecto tienen el formato PXD000001. Datos de EMBL-EBI.

api.oanor.com/pride-api