#mgnify

MGnify como API, impulsado por EMBL-EBI, el recurso gratuito más grande del mundo para el análisis y archivo de datos de secuenciación del microbioma, y la hermana metagenómica de PRIDE (proteómica) y MetaboLights (metabolómica). MGnify alberga decenas de miles de estudios públicos de metagenómica y metabarcoding que abarcan el microbioma intestinal humano, ambientes marinos y de agua dulce, suelos, aguas residuales, el entorno construido y comunidades asociadas a hospedadores. Busque estudios por palabra clave, obteniendo el acceso de MGnify de cada estudio (MGYS...), nombre, resumen, bioma, recuento de muestras y el BioProject de secuenciación de origen; lea los metadatos completos de un estudio, incluidos su nombre y resumen, clasificación del bioma, número de muestras, centro de envío, estado público, origen de los datos y fecha de última actualización; y navegue por el árbol de clasificación de biomas estilo GOLD, desde raíz:Asociado al hospedador:Humano:Sistema digestivo hasta raíz:Ambiental:Acuático:Marino, con recuentos de muestras y estudios por bioma, para descubrimiento por entorno. Ideal para investigación del microbioma y genómica ambiental, reutilización de conjuntos de datos y metaanálisis, pipelines de bioinformática y enseñanza. Los accesos de estudio se ven como MGYS00006862. Datos de EMBL-EBI MGnify.

api.oanor.com/mgnify-api