#mgnify

MGnify en tant qu'API, propulsé par EMBL-EBI — la plus grande ressource gratuite au monde pour l'analyse et l'archivage des données de séquençage du microbiome, et la sœur métagénomique de PRIDE (protéomique) et MetaboLights (métabolomique). MGnify contient des dizaines de milliers d'études publiques de métagénomique et de métabarcodage couvrant le microbiome intestinal humain, les environnements marins et d'eau douce, les sols, les eaux usées, l'environnement bâti et les communautés associées à l'hôte. Recherchez les études par mot-clé, obtenant pour chaque étude son accession MGnify (MGYS...), son nom, son résumé, son biome, le nombre d'échantillons et le BioProject de séquençage source ; lisez les métadonnées complètes d'une étude, y compris son nom et son résumé, la classification du biome, le nombre d'échantillons, le centre de soumission, le statut public, l'origine des données et la date de dernière mise à jour ; et parcourez l'arbre de classification des biomes de style GOLD — de racine:Associé à l'hôte:Humain:Système digestif à racine:Environnemental:Aquatique:Marin — avec des comptes d'échantillons et d'études par biome, pour la découverte par environnement. Idéal pour la recherche sur le microbiome et la génomique environnementale, la réutilisation des ensembles de données et la méta-analyse, les pipelines bioinformatiques et l'enseignement. Les accessions d'étude ressemblent à MGYS00006862. Données provenant d'EMBL-EBI MGnify.

api.oanor.com/mgnify-api