#proteomics

Das PRIDE-Proteomik-Archiv als API, betrieben vom EMBL-EBI PRIDE Archive – dem weltweit größten öffentlichen Repository für Massenspektrometrie-Proteomikdaten und Gründungsmitglied von ProteomeXchange. Durchsuchen Sie öffentliche Proteomik-Experimente nach Stichwort (Rückgabe der Zugangsnummer, des Titels, der Organismen, Krankheiten und Instrumente jedes Projekts); lesen Sie die vollständigen Metadaten eines Projekts, einschließlich seiner Beschreibung, Schlüsselwörter, Organismen und Organismusteile, Massenspektrometrie-Instrumente, Software, identifizierte Proteinmodifikationen, Proben- und Datenverarbeitungsprotokolle, Einreicher, Zugehörigkeiten und die verknüpfte Publikation (DOI und PubMed); listen Sie die Datendateien eines Projekts mit ihrer Kategorie, ihrem Format, ihrer Größe und einem direkten Download-Link auf; und erkunden Sie Facetten – die Krankheiten, Organismen, Instrumente, Experimenttypen, Software und Länder, die in übereinstimmenden Projekten vertreten sind – zur Entdeckung. Ideal für Proteomik- und Systembiologie-Forschung, Datensatz-Wiederverwendung und Metaanalyse, Bioinformatik-Pipelines und Tools, die experimentelle Evidenz integrieren. Projektzugangsnummern sehen aus wie PXD000001. Daten von EMBL-EBI.

api.oanor.com/pride-api

Die UniProt-Proteindatenbank als API, betrieben durch den offiziellen UniProt-REST-Dienst, kuratiert von EMBL-EBI, SIB und PIR. Schlagen Sie jedes Protein nach seiner UniProt-Accession nach, um Protein- und Gennamen, Organismus, Länge, Masse, Funktion, Schlüsselwörter, Gene-Ontology-(GO)-Begriffe und verknüpfte PDB-3D-Strukturen zu erhalten; führen Sie Volltext-Proteinsuchen durch, gefiltert nach Organismus (NCBI-Taxon-ID) und Swiss-Prot-Review-Status; rufen Sie Aminosäuresequenzen mit FASTA, Molekulargewicht und CRC64-Prüfsumme ab; listen Sie Sequenzmerkmale wie Signalpeptide, Ketten, Domänen, aktive und Bindungsstellen, modifizierte Reste und natürliche Varianten auf, mit einer Aufschlüsselung nach Typ; lösen Sie NCBI-Taxonomieknoten mit ihrer vollständigen Abstammungslinie auf; und ziehen Sie Referenzproteome mit Proteinzahlen und Genom-Assembly-IDs. Über alle Reiche des Lebens hinweg, vom Menschen bis zu Bakterien. Ideal für Bioinformatik-Pipelines, Wirkstoffforschungs- und Proteomik-Tools, Sequenzanalyse-Dashboards, akademische Forschungs-Apps und Life-Science-Chatbots.

api.oanor.com/uniprot-api