#proteomics

Het PRIDE-proteomicsarchief als API, aangedreven door het EMBL-EBI PRIDE Archive — 's werelds grootste openbare repository van massaspectrometrie-proteomicsgegevens en een oprichtend lid van ProteomeXchange. Doorzoek de openbare proteomics-experimenten op trefwoord (met terugkeer van elk project's toegangsnummer, titel, organismen, ziekten en instrumenten); lees de volledige metadata van een project inclusief de beschrijving, trefwoorden, organismen en orgaandelen, massaspectrometrie-instrumenten, software, de geïdentificeerde eiwitmodificaties, monster- en dataverwerkingsprotocollen, indieners, affiliaties en de gekoppelde publicatie (DOI en PubMed); toon de gegevensbestanden van een project met hun categorie, formaat, grootte en een directe downloadlink; en verken facetten — de ziekten, organismen, instrumenten, experimenttypen, software en landen die vertegenwoordigd zijn in overeenkomende projecten — voor ontdekking. Ideaal voor proteomics- en systeembiologieonderzoek, hergebruik van datasets en meta-analyse, bioinformatica-pijplijnen en tools die experimenteel bewijs integreren. Projecttoegangsnummers zien eruit als PXD000001. Gegevens van EMBL-EBI.

api.oanor.com/pride-api

De UniProt-eiwitkennisdatabase als een API, aangedreven door de officiële UniProt REST-service, samengesteld door EMBL-EBI, SIB en PIR. Zoek elk eiwit op via zijn UniProt-toegangsnummer voor eiwit- en gennamen, organisme, lengte, massa, functie, trefwoorden, Gene Ontology (GO)-termen en gekoppelde PDB 3D-structuren; voer full-text eiwitzoekopdrachten uit, gefilterd op organisme (NCBI-taxon-id) en Swiss-Prot-beoordelingsstatus; haal aminozuursequenties op met FASTA, molecuulgewicht en CRC64-checksum; vermeld sequentiekenmerken zoals signaalpeptiden, ketens, domeinen, actieve en bindingsplaatsen, gemodificeerde residuen en natuurlijke varianten, met een uitsplitsing per type; los NCBI-taxonomieknooppunten op met hun volledige afstamming; en haal referentieproteomen op met eiwitaantallen en genoomassemblage-ID's. Over alle rijken van het leven, van mens tot bacterie. Ideaal voor bioinformatica-pijplijnen, geneesmiddelenontdekking en proteomicatools, sequentieanalyse-dashboards, academische onderzoeksapps en levenswetenschap-chatbots.

api.oanor.com/uniprot-api