#proteomics

El archivo de proteómica PRIDE como una API, impulsado por el Archivo PRIDE de EMBL-EBI, el repositorio público más grande del mundo de datos de proteómica por espectrometría de masas y miembro fundador de ProteomeXchange. Busque experimentos públicos de proteómica por palabra clave (devolviendo el acceso, título, organismos, enfermedades e instrumentos de cada proyecto); lea los metadatos completos de un proyecto, incluida su descripción, palabras clave, organismos y partes de organismos, instrumentos de espectrometría de masas, software, las modificaciones de proteínas identificadas, protocolos de procesamiento de muestras y datos, remitentes, afiliaciones y la publicación vinculada (DOI y PubMed); enumere los archivos de datos de un proyecto con su categoría, formato, tamaño y un enlace de descarga directa; y explore facetas (las enfermedades, organismos, instrumentos, tipos de experimento, software y países representados en los proyectos coincidentes) para el descubrimiento. Ideal para investigación en proteómica y biología de sistemas, reutilización de conjuntos de datos y metaanálisis, tuberías de bioinformática y herramientas que integran evidencia experimental. Los accesos de proyecto tienen el formato PXD000001. Datos de EMBL-EBI.

api.oanor.com/pride-api

La base de conocimiento de proteínas UniProt como API, impulsada por el servicio REST oficial de UniProt curado por EMBL-EBI, SIB y PIR. Busque cualquier proteína por su acceso UniProt para nombres de proteínas y genes, organismo, longitud, masa, función, palabras clave, términos de Gene Ontology (GO) y estructuras 3D de PDB vinculadas; realice búsquedas de texto completo de proteínas filtradas por organismo (ID de taxón NCBI) y estado de revisión Swiss-Prot; obtenga secuencias de aminoácidos con FASTA, peso molecular y suma de verificación CRC64; enumere características de secuencia como péptidos señal, cadenas, dominios, sitios activos y de unión, residuos modificados y variantes naturales, con un desglose por tipo; resuelva nodos de taxonomía NCBI con su linaje completo; y extraiga proteomas de referencia con recuentos de proteínas e IDs de ensamblaje del genoma. En todos los reinos de la vida, desde humanos hasta bacterias. Ideal para tuberías de bioinformática, herramientas de descubrimiento de fármacos y proteómica, paneles de análisis de secuencias, aplicaciones de investigación académica y chatbots de ciencias de la vida.

api.oanor.com/uniprot-api