oanor
Δωρεάν εγγραφή
Αγορά Τιμές Λειτουργίες Σύνδεση

API · /biomodels-api

BioModels API

υγιής 4,086 Συνδρομητές

BioModels ως API, με την υποστήριξη του EMBL-EBI — το μεγαλύτερο αποθετήριο στον κόσμο επιμελημένων, δημοσιευμένων μαθηματικών μοντέλων βιολογικών συστημάτων. Το BioModels συλλέγει υπολογιστικά μοντέλα (κυρίως σε SBML, τη Γλώσσα Σήμανσης Συστημάτων Βιολογίας) μεταβολισμού, σηματοδότησης κυττάρων, γονιδιακών ρυθμιστικών δικτύων, κυτταρικού κύκλου, διαδικασιών ασθενειών και φυσιολογίας, το καθένα συνδεδεμένο με την αξιολογημένη από ομοτίμους δημοσίευση από την οποία προέρχεται. Το /v1/search?query=glycolysis αναζητά στο αποθετήριο και επιστρέφει κάθε ταιριαστό μοντέλο με το id του (όπως BIOMD0000000012), όνομα, μορφή, υποβολέα και ημερομηνίες υποβολής/τροποποίησης. Το /v1/model?id=BIOMD0000000012 επιστρέφει τα μεταδεδομένα ενός μοντέλου — το όνομα και την περιγραφή του, τη μορφή κωδικοποίησης, την προσέγγιση μοντελοποίησης (π.χ. μοντέλο συνήθων διαφορικών εξισώσεων), την κατάσταση επιμέλειας, τη δημοσίευση πίσω από αυτό (τίτλος, περιοδικό, έτος, συγγραφείς) και τα αρχεία μοντέλου. Τα id μοντέλων μοιάζουν με BIOMD0000000012 για επιμελημένα μοντέλα ή MODEL1234567890 για μη επιμελημένες υποβολές· λάβετε τα από το τελικό σημείο αναζήτησης. Ιδανικό για εργαλεία συστημικής βιολογίας και υπολογιστικής μοντελοποίησης, ροές εργασίας αναπαραγώγιμης έρευνας και επαναχρησιμοποίησης μοντέλων, και διδασκαλία. Δεδομένα από EMBL-EBI BioModels (CC0). Πρόκειται για ένα αποθετήριο συστημικής βιολογίας / υπολογιστικών μοντέλων — διακριτό από βάσεις δεδομένων αλληλουχίας (UniProt, ENA), δομής (PDB, AlphaFold), μονοπατιών και παραλλαγών (ClinVar).

#biomodels #systems-biology #sbml #computational-biology #embl-ebi #modelling #bioinformatics
api.oanor.com/biomodels-api
Λάβετε ένα κλειδί API Δοκιμάστε στην παιδική χαρά → Επικοινωνήστε με τον πάροχο

Προδιαγραφές αναγνώσιμες από μηχανή, ώστε οι πράκτορες AI να μπορούν να ενσωματώσουν αυτό το API.

/api/biomodels-api/openapi.json
/api/biomodels-api/llms.txt

Ανακάλυψη: Το GET /api/index.json παραθέτει κάθε API.

Υγεία API

υγιής
Χρόνος λειτουργίας
100.00%
Ανιχνευτές διακομιστή · 24 ώρες
Μέση καθυστέρηση
918 ms
Ανιχνευτές διακομιστή · 24 ώρες
Συνδρομητές
4,086
ενεργός
Σύνολο κλήσεων
6
τις τελευταίες 7 ημέρες
status Πλήρης σελίδα κατάστασης → · 9 ανιχνευτές/24 ώρες

Τιμολόγηση

Επιλέξτε μια βαθμίδα — χρεώνεται μηνιαία, ακυρώστε ανά πάσα στιγμή.

Free

Δωρεάν

  • 2,250 κλήσεις / μήνα
  • 2 αιτήματα / δευτερόλεπτο
  • Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
  • 2250 κλήσεις/μήνα
  • 2 αιτήσεις/δευτερόλεπτο
  • Αναζήτηση & μεταδεδομένα μοντέλου
  • Χωρίς πιστωτική κάρτα
Συνδεθείτε για να εγγραφείτε

Starter

€7.00 /μήνας

  • 48,500 κλήσεις / μήνα
  • 5 αιτήματα / δευτερόλεπτο
  • Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
  • 48.5k κλήσεις/μήνα
  • 5 αιτήσεις/δευτ.
  • Δημοσίευση & προσέγγιση
  • Υποστήριξη μέσω email
Συνδεθείτε για να εγγραφείτε

Pro

€20.50 /μήνας

  • 216,000 κλήσεις / μήνα
  • 12 αιτήματα / δευτερόλεπτο
  • Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
  • 216k κλήσεις/μήνα
  • 12 req/sec
  • Επαναχρησιμοποίηση μοντέλων & pipelines
  • Υποστήριξη προτεραιότητας
Συνδεθείτε για να εγγραφείτε

Mega

€54.50 /μήνας

  • 782,000 κλήσεις / μήνα
  • 35 αιτήματα / δευτερόλεπτο
  • Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
  • 782k κλήσεις/μήνα
  • 35 req/sec
  • Μοντελοποίηση υψηλής απόδοσης
  • Αποκλειστικό SLA
Συνδεθείτε για να εγγραφείτε

Κατασκευάστηκε από

P
PremiumApi

Σχετικό API

Άλλο API με επικαλυπτόμενες ετικέτες.

API Αλληλεπιδράσεων Πρωτεϊνών

Δίκτυα αλληλεπιδράσεων πρωτεΐνης-πρωτεΐνης ως API — υποστηρίζεται από το STRING, τη βάση δεδομένων γνωστών και προβλεπόμενων συσχετίσεων πρωτεϊνών που συνδυάζει στοιχεία από εργαστηριακά πειράματα, επιμελημένες βάσεις δεδομένων μονοπατιών, γονιδιακή συνεκφραση, γονιδιωματικό πλαίσιο και αυτοματοποιημένη εξόρυξη κειμένου σε μια ενιαία βαθμολογία εμπιστοσύνης, σε χιλιάδες οργανισμούς. Λάβετε τους κορυφαίους συνεργάτες αλληλεπίδρασης μιας πρωτεΐνης (καθένας με τη συνδυασμένη βαθμολογία εμπιστοσύνης και τις επτά υποβαθμολογίες καναλιών απόδειξης), το δίκτυο αλληλεπίδρασης μεταξύ οποιουδήποτε συνόλου πρωτεϊνών ως βαθμολογημένες ακμές και λειτουργικό εμπλουτισμό για ένα σύνολο γονιδίων — τους υπερ-αντιπροσωπευόμενους όρους GO, μονοπάτια KEGG, τομείς Pfam και άλλα, το καθένα με την p-τιμή, το FDR και τα μέλη γονίδιά του. Περάστε σύμβολα γονιδίων (TP53) ή αναγνωριστικά STRING/Ensembl, για άνθρωπο (προεπιλογή) ή οποιοδήποτε είδος με αναγνωριστικό ταξινομίας NCBI. Είναι ακρογωνιαίος λίθος της συστημικής βιολογίας — ιδανικό για ανάλυση δικτύων, λειτουργική γονιδιωματική, μονοπάτια και εργαλεία βιοπληροφορικής. Ένας πόρος δικτύου αλληλεπίδρασης πρωτεϊνών — διακριτός από βιολογικά μονοπάτια (Reactome), επιμελημένα σύμπλοκα πρωτεϊνών (Complex Portal) και σχολιασμούς Γονιδιακής Οντολογίας (QuickGO). Ανοιχτά δεδομένα από το STRING (CC BY 4.0).

api.oanor.com/stringdb-api

STRING API

Η βάση δεδομένων αλληλεπιδράσεων πρωτεϊνών STRING ως API — το επιμελημένο και προβλεπόμενο δίκτυο λειτουργικών συσχετίσεων μεταξύ πρωτεϊνών, που υποστηρίζεται από το επίσημο STRING API. Επιλύστε ονόματα γονιδίων ή πρωτεϊνών σε αναγνωριστικά STRING με σχολιασμούς· λάβετε τους κορυφαίους συνεργάτες αλληλεπίδρασης μιας πρωτεΐνης με συνδυασμένη βαθμολογία εμπιστοσύνης και ανά κανάλι αποδείξεις (πειραματικές, επιμελημένες βάσεις δεδομένων, συνέκφραση, εξόρυξη κειμένου, γονιδιακή σύντηξη, γειτνίαση και συν-εμφάνιση)· δημιουργήστε το δίκτυο αλληλεπιδράσεων μεταξύ ενός συνόλου πρωτεϊνών ως ακμές με βαθμολογία· εκτελέστε λειτουργικό εμπλουτισμό ενός συνόλου γονιδίων σε Gene Ontology, KEGG, Reactome, Pfam, InterPro και άλλα με p-τιμές και ποσοστά ψευδούς ανακάλυψης· και βαθμολογήστε ομολογία μεταξύ πρωτεϊνών. Καλύπτει 12.000+ οργανισμούς (προεπιλογή άνθρωπος, NCBI taxon 9606). Ιδανικό για συστημική βιολογία και δίκτυα βιολογίας, ανάλυση γονιδιακών συνόλων και μονοπατιών, έρευνα φαρμακευτικών στόχων και γονιδίων ασθενειών, και πίνακες ελέγχου βιοπληροφορικής.

api.oanor.com/string-api

API Reactome

Η βάση γνώσεων μονοπατιών Reactome ως API — η ανοιχτή, αξιολογημένη από ομοτίμους βάση δεδομένων βιολογικών μονοπατιών και αντιδράσεων, που υποστηρίζεται από την επίσημη Υπηρεσία Περιεχομένου Reactome. Αναζητήστε την επιμελημένη συλλογή μονοπατιών, αντιδράσεων και μορίων· διαβάστε οποιαδήποτε οντότητα με το σταθερό αναγνωριστικό Reactome (ένα μονοπάτι, αντίδραση, σύμπλοκο ή πρωτεΐνη: όνομα, τύπος, είδος, διαμερίσματα, περίληψη και δείκτης ασθένειας)· λίστα γεγονότων (υπο-μονοπάτια και αντιδράσεις) που περιέχονται σε ένα μονοπάτι· λίστα μορίων που συμμετέχουν σε ένα μονοπάτι ή αντίδραση με τα αναγνωριστικά αναφοράς τους· λάβετε τα κορυφαία μονοπάτια για οποιονδήποτε οργανισμό-μοντέλο· αντιστοιχίστε μια πρωτεΐνη UniProt στα μονοπάτια στα οποία συμμετέχει· και λίστα των υποστηριζόμενων ειδών. Καλύπτει ανθρώπους και 15+ οργανισμούς-μοντέλα σε μεταβολισμό, μεταγωγή σήματος, κυτταρικό κύκλο, ανοσοποιητικό σύστημα, ασθένειες και άλλα. Ιδανικό για συστημική βιολογία και βιοπληροφορικές ροές εργασίας, εργαλεία εμπλουτισμού μονοπατιών και φαρμακευτικών στόχων, εφαρμογές βιοϊατρικής έρευνας, εκπαιδευτικούς πόρους και chatbots επιστημών ζωής.

api.oanor.com/reactome-api

BioSamples API

BioSamples ως API, με την υποστήριξη του EMBL-EBI — η βάση δεδομένων που αποθηκεύει και συνδέει τα μεταδεδομένα βιολογικών δειγμάτων, τα φυσικά δείγματα πίσω από βιολογικά πειράματα. Ένα δείγμα στο BioSamples φέρει μια σταθερή πρόσβαση (όπως SAMEA3231268) και ένα πλούσιο σύνολο χαρακτηριστικών — οργανισμός, ιστός ή μέρος οργανισμού, τύπος κυττάρου, φύλο, ασθένεια, αναπτυξιακό στάδιο, στέλεχος και οποιαδήποτε χαρακτηριστικά παρέχονται από τον υποβάλλοντα — και αναφέρεται από άλλα αρχεία του EBI, συμπεριλαμβανομένων του European Nucleotide Archive (ENA), του ArrayExpress και του PRIDE. Το /v1/search?q=liver αναζητά δείγματα με ελεύθερο κείμενο και επιστρέφει την πρόσβαση, το όνομα, τον οργανισμό και την ημερομηνία κυκλοφορίας κάθε αντιστοιχίας. Το /v1/sample?id=SAMEA3231268 επιστρέφει τα μεταδεδομένα ενός δείγματος — την πρόσβαση, το όνομα, το αναγνωριστικό ταξινομίας NCBI, τον οργανισμό, τις ημερομηνίες κυκλοφορίας και ενημέρωσης, τον αριθμό σχέσεων με άλλα δείγματα και τα χαρακτηριστικά του που έχουν μετατραπεί σε έναν καθαρό χάρτη κλειδιού→τιμής. Οι προσβάσεις μοιάζουν με SAMEA…, SAMN… ή SAMD…· μπορείτε να λάβετε μία από το τελικό σημείο αναζήτησης. Ιδανικό για ενοποίηση δεδομένων βιοεπιστημών, παρακολούθηση δειγμάτων, εναρμόνιση μεταδεδομένων και σύνδεση δεδομένων αλληλούχισης ή έκφρασης με το αρχικό δείγμα. Δεδομένα από το EMBL-EBI BioSamples (δημόσια). Πρόκειται για ένα μητρώο μεταδεδομένων βιολογικών δειγμάτων — διακριτό από βάσεις δεδομένων μελετών (BioStudies), αλληλουχιών (ENA), παραλλαγών (ClinVar) και δομών.

api.oanor.com/biosamples-api

Συχνές ερωτήσεις

Γρήγορες απαντήσεις για τιμές, ποσοστώσεις και ενσωμάτωση.

Πώς αποκτώ ένα κλειδί API για το BioModels API;
Εγγράψου δωρεάν στο oanor.com, δημιούργησε ένα κλειδί API από τον πίνακα ελέγχου προγραμματιστή και κάλεσε το BioModels API με την κεφαλίδα x-oanor-key. Δεν απαιτείται πιστωτική κάρτα για το δωρεάν πλάνο.
Ποιο είναι το όριο ρυθμού του BioModels API;
Το δωρεάν πλάνο επιτρέπει 1 αίτημα ανά δευτερόλεπτο. Τα επί πληρωμή πλάνα κλιμακώνονται έως 50 αιτήματα ανά δευτερόλεπτο στο επίπεδο Mega. Τα αυστηρά όρια επιστρέφουν HTTP 429 πάνω από την ποσόστωση — χωρίς εκπλήξεις στις χρεώσεις υπερβάσεων.
Πόσο κοστίζει το BioModels API;
Το BioModels API έχει δωρεάν πλάνο με 100 κλήσεις / μήνα. Τα επί πληρωμή πλάνα ξεκινούν από €7.00 / μήνα με υψηλότερες ποσοστώσεις και ταχύτερα όρια ρυθμού.
Μπορώ να ακυρώσω τη συνδρομή μου ανά πάσα στιγμή;
Ναι. Τα πλάνα χρεώνονται μηνιαίως και μπορείς να ακυρώσεις οποτεδήποτε από το ταμπλό χρέωσης. Χωρίς μακροπρόθεσμα συμβόλαια και χωρίς τέλος ακύρωσης.
Είναι το BioModels API συμβατό με τον GDPR;
Όλα τα αιτήματα προς BioModels API περνούν μέσω της πύλης μας στην ΕΕ. Το upstream API κλειδί σου δεν φεύγει ποτέ από τον διακομιστή μας και δεν μοιράζονται προσωπικά δεδομένα με τον upstream πάροχο πέρα από το αίτημα που στέλνεις.

Επιλέξτε ένα τελικό σημείο από τη λίστα στα αριστερά για να δείτε τις λεπτομέρειες και δοκιμάστε το.

Αποσπάσματα κώδικα

Εγγραφείτε για να λάβετε ένα API key και, στη συνέχεια, καλέστε οποιαδήποτε διαδρομή κάτω από το slug σας.

curl https://api.oanor.com/biomodels-api/SOME_PATH \
  -H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/biomodels-api/SOME_PATH", {
  headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/biomodels-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
    "https://api.oanor.com/biomodels-api/SOME_PATH",
    headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())

Αξιολογήσεις

Συνδεθείτε για να βαθμολογήσετε.

Δεν υπάρχουν ακόμη κριτικές.

Συζήτηση

Κάνε ερωτήσεις, μοιράσου συμβουλές, πάρε απαντήσεις από τον πάροχο και άλλους προγραμματιστές. Δημόσιο — όλοι μπορούν να διαβάσουν.

Συνδέσου για να γράψεις ή να απαντήσεις.

Σύνδεση

Νέα συζήτηση

/ 4000

📌 Καρφιτσωμένη 🔒 Κλειδωμένη

·

· ·

/ 4000

🔒 Η συζήτηση είναι κλειδωμένη — δεν επιτρέπονται νέες απαντήσεις.

  • Δεν υπάρχουν συζητήσεις — ξεκίνα την πρώτη.

Υποστήριξη

Ιδιωτική υποστήριξη 1:1 με τον πάροχο — χρέωση, ενσωμάτωση, λογαριασμός. Μόνο εσύ και η ομάδα του παρόχου βλέπετε αυτά τα threads.

Συνδέσου για να ανοίξεις ticket υποστήριξης.

Σύνδεση

Άνοιγμα νέου ticket

Περιέγραψε με τι χρειάζεσαι βοήθεια. Η ομάδα λαμβάνει email και απαντά στη σελίδα του ticket.

  • Δεν υπάρχουν tickets για αυτό το API.

Η συνδρομή είναι ενεργή — οι κλήσεις μπορούν να ξεκινήσουν αμέσως.

Στείλτε το πρώτο σας αίτημα —

Η συνδρομή είναι ενεργή — αντιγράψτε ένα απόσπασμα και ενεργοποιήστε την πρώτη σας κλήση.