oanor
Gratis registreren
Marktplaats Prijzen Functies Inloggen

API · /biomodels-api

BioModels API

gezond 4,086 Abonnees

BioModels als API, aangedreven door EMBL-EBI — 's werelds grootste repository van gecureerde, gepubliceerde wiskundige modellen van biologische systemen. BioModels verzamelt computationele modellen (meestal in SBML, de Systems Biology Markup Language) van metabolisme, celsignalering, genregulatienetwerken, de celcyclus, ziekteprocessen en fysiologie, elk gekoppeld aan de peer-reviewed publicatie waaruit het afkomstig is. /v1/search?query=glycolysis doorzoekt de repository en retourneert voor elk overeenkomend model de id (zoals BIOMD0000000012), naam, formaat, indiener en inzendings-/wijzigingsdatums. /v1/model?id=BIOMD0000000012 retourneert de metadata van een model — de naam en beschrijving, het coderingsformaat, de modelleringsaanpak (bijv. gewone differentiaalvergelijkingmodel), de curatiestatus, de publicatie erachter (titel, tijdschrift, jaar, auteurs) en de modelbestanden. Model-ID's zien eruit als BIOMD0000000012 voor gecureerde modellen of MODEL1234567890 voor niet-gecureerde inzendingen; haal ze op uit het zoekendpoint. Ideaal voor systeembiologie- en computationele modelleringstools, reproduceerbaar onderzoek en modelhergebruikworkflows, en onderwijs. Gegevens van EMBL-EBI BioModels (CC0). Dit is een systeembiologie-/computationeel-modelrepository — te onderscheiden van sequentie- (UniProt, ENA), structuur- (PDB, AlphaFold), pathway- en variantdatabases (ClinVar).

#biomodels #systems-biology #sbml #computational-biology #embl-ebi #modelling #bioinformatics
api.oanor.com/biomodels-api
Verkrijg een API-sleutel Probeer het in de speeltuin → Provider contacteren

Machineleesbare specificaties zodat AI-agenten deze API kunnen integreren.

/api/biomodels-api/openapi.json
/api/biomodels-api/llms.txt

Ontdekking: GET /api/index.json vermeldt elke API.

API-gezondheid

gezond
Uptime
100.00%
Serversondes · 24 uur
Gem. latentie
918 ms
Serversondes · 24 uur
Abonnees
4,086
actief
Totaal aantal oproepen
6
laatste 7 dagen
status Volledige statuspagina → · 9 sondes/24u

Prijzen

Kies een niveau: maandelijks gefactureerd en op elk gewenst moment opzegbaar.

Free

Vrij

  • 2,250 oproepen / maand
  • 2 verzoeken / tweede
  • Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
  • 2250 oproepen/maand
  • 2 verzoeken/sec
  • Zoek- en modelmetadata
  • Geen creditcard
Meld u aan om u te abonneren

Starter

€7.00 /maand

  • 48,500 oproepen / maand
  • 5 verzoeken / tweede
  • Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
  • 48.5k oproepen/maand
  • 5 verzoeken/sec
  • Publicatie & aanpak
  • E-mailondersteuning
Meld u aan om u te abonneren

Pro

€20.50 /maand

  • 216,000 oproepen / maand
  • 12 verzoeken / tweede
  • Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
  • 216k oproepen/maand
  • 12 verzoeken/sec
  • Modelhergebruik & pipelines
  • Prioritaire ondersteuning
Meld u aan om u te abonneren

Mega

€54.50 /maand

  • 782,000 oproepen / maand
  • 35 verzoeken / tweede
  • Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
  • 782k oproepen/maand
  • 35 verzoeken/sec
  • Modellering met hoge doorvoer
  • Toegewijde SLA
Meld u aan om u te abonneren

Gebouwd door

P
PremiumApi

Gerelateerd APIs

Andere APIs met overlappende tags.

Protein Interactions API

Eiwit-eiwit interactienetwerken als een API — aangedreven door STRING, de database van bekende en voorspelde eiwitassociaties die bewijs uit laboratoriumexperimenten, samengestelde pathway-databases, gen-co-expressie, genomische context en geautomatiseerde tekstmining combineert in één betrouwbaarheidsscore, voor duizenden organismen. Verkrijg de top interactiepartners van een eiwit (elk met de gecombineerde betrouwbaarheidsscore en de zeven bewijskanaal-subscores), het interactienetwerk tussen een willekeurige set eiwitten als gescoorde randen, en functionele verrijking voor een genset — de oververtegenwoordigde GO-termen, KEGG-pathways, Pfam-domeinen en meer, elk met zijn p-waarde, FDR en lidgenen. Geef gensymbolen (TP53) of STRING/Ensembl-id's, voor menselijk (standaard) of elke soort via NCBI-taxon-id. Het is een hoeksteen van systeembiologie — ideaal voor netwerkanalyse, functionele genomica, pathway- en bioinformatica-tools. Een eiwit-interactienetwerk-bron — onderscheiden van biologische pathways (Reactome), samengestelde eiwitcomplexen (Complex Portal) en Gene Ontology-annotaties (QuickGO). Open data van STRING (CC BY 4.0).

api.oanor.com/stringdb-api

STRING API

De STRING-eiwit-eiwitinteractiedatabase als een API — het samengestelde en voorspelde netwerk van functionele associaties tussen eiwitten, aangedreven door de officiële STRING API. Los gen- of eiwitnamen op naar STRING-identificatoren met annotaties; verkrijg de belangrijkste interactiepartners van een eiwit met een gecombineerde betrouwbaarheidsscore en bewijs per kanaal (experimenteel, samengestelde databases, co-expressie, text-mining, genfusie, nabuurschap en co-occurrence); bouw het interactienetwerk tussen een set eiwitten als gescoorde randen; voer functionele verrijking uit van een genset over Gene Ontology, KEGG, Reactome, Pfam, InterPro en meer met p-waarden en false-discovery rates; en score homologie tussen eiwitten. Bestrijkt 12.000+ organismen (standaard mens, NCBI taxon 9606). Ideaal voor systeembiologie- en netwerkbiologie-pijplijnen, genset- en pathway-analyse, geneesmiddeldoelwit- en ziektegenonderzoek, en bioinformatica-dashboards.

api.oanor.com/string-api

Reactome API

De Reactome pathway-kennisbank als API — de open, peer-reviewed database van biologische pathways en reacties, aangedreven door de officiële Reactome ContentService. Doorzoek de samengestelde archieven van pathways, reacties en moleculen; lees elke entiteit op basis van zijn Reactome stabiele ID (een pathway, reactie, complex of eiwit: naam, type, soort, compartimenten, samenvatting en ziekte-indicator); toon de gebeurtenissen (sub-pathways en reacties) in een pathway; toon de moleculen die deelnemen aan een pathway of reactie met hun referentie-identificatoren; verkrijg de top-level pathways voor elk modelorganisme; koppel een UniProt-eiwit aan de pathways waarin het deelneemt; en toon de ondersteunde soorten. Omvat mens en 15+ modelorganismen in metabolisme, signaaltransductie, celcyclus, immuunsysteem, ziekte en meer. Ideaal voor systeembiologie en bioinformatica-pijplijnen, pathway-verrijkings- en medicijndoelwit-tools, biomedische onderzoeksapps, lesmateriaal en levenswetenschap-chatbots.

api.oanor.com/reactome-api

BioSamples API

BioSamples als API, aangedreven door EMBL-EBI — de database die de metadata van biologische monsters opslaat en koppelt, de fysieke specimens achter biologische experimenten. Een monster in BioSamples heeft een stabiele toegang (zoals SAMEA3231268) en een rijke set kenmerken — organisme, weefsel of orgaandeel, celtype, geslacht, ziekte, ontwikkelingsstadium, stam en alle door de indiener verstrekte attributen — en wordt gerefereerd door andere EBI-archieven, waaronder het European Nucleotide Archive (ENA), ArrayExpress en PRIDE. /v1/search?q=liver doorzoekt monsters op vrije tekst en retourneert de toegang, naam, organisme en releasedatum van elke overeenkomst. /v1/sample?id=SAMEA3231268 retourneert de metadata van een monster — de toegang, naam, NCBI-taxon-id, organisme, release- en updatedatums, het aantal relaties met andere monsters, en de kenmerken afgevlakt tot een schone sleutel→waarde-kaart. Toegangen zien eruit als SAMEA…, SAMN… of SAMD…; haal er een uit het zoekendpoint. Ideaal voor levenswetenschappelijke data-integratie, monstertracking, metadata-harmonisatie en het koppelen van sequencing- of expressiegegevens terug naar het oorspronkelijke specimen. Gegevens van EMBL-EBI BioSamples (openbaar). Dit is een biologisch-monster-metadataregister — te onderscheiden van studie- (BioStudies), sequentie- (ENA), variant- (ClinVar) en structuurdatabases.

api.oanor.com/biosamples-api

Veelgestelde vragen

Snelle antwoorden over prijzen, quota's en integratie.

Hoe krijg ik een API-sleutel voor BioModels API?
Registreer gratis op oanor.com, genereer een API-sleutel in het ontwikkelaarsdashboard en roep BioModels API aan met de x-oanor-key-header. Geen creditcard nodig voor het gratis abonnement.
Wat is de rate-limit voor BioModels API?
Het gratis pakket staat 1 verzoek per seconde toe. Betaalde pakketten schalen tot 50 verzoeken per seconde op het Mega-niveau. Harde limieten geven HTTP 429 boven de quota — geen verrassende meerkosten.
Wat kost BioModels API?
BioModels API heeft een gratis pakket met 100 calls / maand. Betaalde pakketten beginnen bij €7.00 / maand met hogere quota's en snellere rate-limits.
Kan ik mijn abonnement op elk moment opzeggen?
Ja. Abonnementen worden maandelijks gefactureerd en je kunt op elk moment opzeggen via je facturatie-dashboard. Geen langetermijncontracten en geen opzegkosten.
Voldoet BioModels API aan de AVG?
Alle aanvragen aan BioModels API lopen via onze EU-gateway. Je upstream-API-sleutel verlaat nooit onze server en er worden geen persoonsgegevens gedeeld met de upstream-leverancier behalve de aanvraag zelf.

Kies een eindpunt uit de lijst aan de linkerkant om de details ervan te bekijken en het te proberen.

Codefragmenten

Meld u aan om een ​​API-sleutel te krijgen en roep vervolgens een pad onder uw naaktslak aan.

curl https://api.oanor.com/biomodels-api/SOME_PATH \
  -H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/biomodels-api/SOME_PATH", {
  headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/biomodels-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
    "https://api.oanor.com/biomodels-api/SOME_PATH",
    headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())

Beoordelingen

Log in om te beoordelen.

Nog geen beoordelingen.

Discussie

Stel vragen, deel tips, krijg antwoorden van de aanbieder en andere ontwikkelaars. Openbaar — iedereen kan meelezen.

Meld je aan om te schrijven of te antwoorden.

Inloggen

Nieuwe discussie

/ 4000

📌 Vastgepind 🔒 Vergrendeld

·

· ·

/ 4000

🔒 Deze discussie is vergrendeld — geen nieuwe antwoorden.

  • Nog geen discussies — start de eerste.

Support

Privé 1:1-support met de aanbieder — facturatie, integratie, account. Alleen jij en het aanbiedersteam zien deze threads.

Meld je aan om een supportticket te openen.

Inloggen

Nieuw ticket openen

Beschrijf waar je hulp bij nodig hebt. Het team krijgt een mail en antwoordt op de ticketpagina.

  • Nog geen tickets voor deze API.

Abonnement actief: calls kunnen direct starten.

Verstuur uw eerste aanvraag —

Abonnement actief: kopieer een fragment en start uw eerste oproep.