Search structural variants by gene or text
API · /dbvar-api
API Δομικών Παραλλαγών
Ανθρώπινη γονιδιωματική δομική παραλλαγή ως API — υποστηρίζεται από το NCBI dbVar, το αρχείο δομικών παραλλαγών (SVs): παραλλαγές αριθμού αντιγράφων (CNVs), μεγάλες διαγραφές, διπλασιασμοί, ενθέσεις, αναστροφές και μετατοπίσεις, συνήθως μεγαλύτερες από 50 ζεύγη βάσεων. Αυτό είναι το δομικό αντίστοιχο των βάσεων δεδομένων παραλλαγών μονού νουκλεοτιδίου: αναζητήστε δομικές παραλλαγές που επικαλύπτουν ένα γονίδιο (ή με ελεύθερο κείμενο) και λάβετε την πρόσβαση dbVar κάθε παραλλαγής, τη μελέτη από την οποία προήλθε, τον τύπο της, τα γονίδια που επικαλύπτει, τη γονιδιωματική της θέση στο GRCh38 και την κλινική της σημασία· στη συνέχεια, αναζητήστε οποιαδήποτε παραλλαγή για το πλήρες αρχείο — θέσεις και στα δύο συναρμολογήματα GRCh37 και GRCh38, τύπο παραλλαγής, γονίδια, κλινική σημασία, τύπο μελέτης, μεθόδους και αριθμούς παραλλαγών. Από CNVs BRCA1 έως διαγραφές Cri-du-chat, είναι ιδανικό για εργασίες γονιδιωματικής, κυτταρογενετικής, σπάνιων ασθενειών και βιοπληροφορικής. Ένας πόρος δομικής παραλλαγής / CNV — διακριτός από την ερμηνεία κλινικών παραλλαγών μονού νουκλεοτιδίου (ClinVar), τις συχνότητες αλληλόμορφων πληθυσμού (gnomAD) και τις συσχετίσεις χαρακτηριστικών (GWAS). Ανοικτά δεδομένα από το NCBI dbVar (δημόσιος τομέας).
Υγεία API
υγιής- Χρόνος λειτουργίας
- 100.00%
- Ανιχνευτές διακομιστή · 24 ώρες
- Μέση καθυστέρηση
- 653 ms
- Ανιχνευτές διακομιστή · 24 ώρες
- Συνδρομητές
- 3,231
- ενεργός
- Σύνολο κλήσεων
- 0
- τις τελευταίες 7 ημέρες
Τιμολόγηση
Επιλέξτε μια βαθμίδα — χρεώνεται μηνιαία, ακυρώστε ανά πάσα στιγμή.
Free
Δωρεάν
- 2,280 κλήσεις / μήνα
- 2 αιτήματα / δευτερόλεπτο
- Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
- 2.280 κλήσεις/μήνα
- 2 αιτήματα/δευτερόλεπτο
- Αναζήτηση + αναζήτηση παραλλαγών
- Χωρίς πιστωτική κάρτα
Starter
€6.45 /μήνας
- 45,500 κλήσεις / μήνα
- 8 αιτήματα / δευτερόλεπτο
- Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
- 45.5k κλήσεις/μήνα
- 8 req/sec
- GRCh37 + GRCh38 τοποθετήσεις
- Υποστήριξη μέσω email
Pro
€21.00 /μήνας
- 228,000 κλήσεις / μήνα
- 20 αιτήματα / δευτερόλεπτο
- Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
- 228k κλήσεις/μήνα
- 20 αιτήσεις/δευτ.
- Εφαρμογές γονιδιωματικής & κυτταρογενετικής
- Υποστήριξη προτεραιότητας
Mega
€56.90 /μήνας
- 830,000 κλήσεις / μήνα
- 50 αιτήματα / δευτερόλεπτο
- Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
- 830k κλήσεις/μήνα
- 50 req/sec
- Πλατφόρμα ανάλυσης παραλλαγών
- Αποκλειστική SLA
Κατασκευάστηκε από
Σχετικό API
Άλλο API με επικαλυπτόμενες ετικέτες.
API Συναρμολογήσεων Γονιδιώματος
Συναρμολογήσεις γονιδιώματος αναφοράς ως API — με τη δύναμη του NCBI Assembly, του καταλόγου γονιδιωματικών κατασκευών για οργανισμούς σε όλο το δέντρο της ζωής. Αναζητήστε συναρμολογήσεις ανά οργανισμό (ή ελεύθερο κείμενο) και δείτε τα μεταδεδομένα οποιασδήποτε συναρμολόγησης: την πρόσβασή της (GCF_… RefSeq ή GCA_… GenBank), το όνομα (π.χ. GRCh38.p14), τον οργανισμό και το αναγνωριστικό taxon, το επίπεδο συναρμολόγησης (πλήρες γονιδίωμα, χρωμόσωμα, σκαλωσιά ή contig), στατιστικά συνέχειας (N50 contig και scaffold), κάλυψη αλληλούχισης, κατηγορία RefSeq, ονόματα UCSC και Ensembl, τον οργανισμό υποβολής, ημερομηνία κυκλοφορίας και διαδρομές λήψης FTP. Από το ανθρώπινο γονιδίωμα αναφοράς έως οποιονδήποτε αλληλουχημένο μικροοργανισμό, φυτό ή ζώο, μετατρέπει τον κατάλογο συναρμολογήσεων γονιδιώματος σε ένα καθαρό API αναζήτησης και λήψης. Ένας κατάλογος συναρμολογήσεων γονιδιώματος — διακριτός από βάσεις δεδομένων αλληλουχίας (ENA), γονιδιωματικής σχολιασμού (Ensembl), παραλλαγών (ClinVar, dbVar) και γονιδιακής έκφρασης (GEO). Ανοικτά δεδομένα από το NCBI Assembly (δημόσιος τομέας).
api.oanor.com/genomes-api
API Γονιδιακής Έκφρασης
Πειράματα λειτουργικής γονιδιωματικής ως API — υποστηρίζεται από το NCBI GEO (Gene Expression Omnibus), το μεγαλύτερο δημόσιο αποθετήριο δεδομένων γονιδιακής έκφρασης. Το GEO αρχειοθετεί σειρές έκφρασης και επιμελημένα σύνολα δεδομένων από πειράματα μικροσυστοιχιών και αλληλούχησης υψηλής απόδοσης σε κάθε οργανισμό. Αναζητήστε πειράματα με λέξη-κλειδί και προαιρετικά με οργανισμό, και αναζητήστε οποιαδήποτε σειρά ή σύνολο δεδομένων για να λάβετε τα μεταδεδομένα του: τίτλο, περίληψη, τύπο ανάλυσης (προφίλ έκφρασης με μικροσυστοιχία ή με αλληλούχηση), οργανισμό, αριθμό δειγμάτων, πλατφόρμα και τη δημοσίευση που το υποστηρίζει. Από μελέτες στρες β-κυττάρων έως μεταγραφομική καρκίνου σε άνθρωπο και ποντίκι, μετατρέπει το αρχείο GEO σε ένα απλό API αναζήτησης και ανάκτησης για μεταγραφομική, βιοπληροφορική και ανακάλυψη ερευνητικών δεδομένων. Ένα αποθετήριο συνόλων δεδομένων γονιδιακής έκφρασης / λειτουργικής γονιδιωματικής — διακριτό από βάσεις δεδομένων αλληλουχίας (ENA), παραλλαγών (ClinVar, dbVar), δομής (PDB) και οντολογιών. Ανοικτά δεδομένα από το NCBI GEO (δημόσιος τομέας).
api.oanor.com/geodatasets-api
API Αλληλεπιδράσεων Πρωτεϊνών
Δίκτυα αλληλεπιδράσεων πρωτεΐνης-πρωτεΐνης ως API — υποστηρίζεται από το STRING, τη βάση δεδομένων γνωστών και προβλεπόμενων συσχετίσεων πρωτεϊνών που συνδυάζει στοιχεία από εργαστηριακά πειράματα, επιμελημένες βάσεις δεδομένων μονοπατιών, γονιδιακή συνεκφραση, γονιδιωματικό πλαίσιο και αυτοματοποιημένη εξόρυξη κειμένου σε μια ενιαία βαθμολογία εμπιστοσύνης, σε χιλιάδες οργανισμούς. Λάβετε τους κορυφαίους συνεργάτες αλληλεπίδρασης μιας πρωτεΐνης (καθένας με τη συνδυασμένη βαθμολογία εμπιστοσύνης και τις επτά υποβαθμολογίες καναλιών απόδειξης), το δίκτυο αλληλεπίδρασης μεταξύ οποιουδήποτε συνόλου πρωτεϊνών ως βαθμολογημένες ακμές και λειτουργικό εμπλουτισμό για ένα σύνολο γονιδίων — τους υπερ-αντιπροσωπευόμενους όρους GO, μονοπάτια KEGG, τομείς Pfam και άλλα, το καθένα με την p-τιμή, το FDR και τα μέλη γονίδιά του. Περάστε σύμβολα γονιδίων (TP53) ή αναγνωριστικά STRING/Ensembl, για άνθρωπο (προεπιλογή) ή οποιοδήποτε είδος με αναγνωριστικό ταξινομίας NCBI. Είναι ακρογωνιαίος λίθος της συστημικής βιολογίας — ιδανικό για ανάλυση δικτύων, λειτουργική γονιδιωματική, μονοπάτια και εργαλεία βιοπληροφορικής. Ένας πόρος δικτύου αλληλεπίδρασης πρωτεϊνών — διακριτός από βιολογικά μονοπάτια (Reactome), επιμελημένα σύμπλοκα πρωτεϊνών (Complex Portal) και σχολιασμούς Γονιδιακής Οντολογίας (QuickGO). Ανοιχτά δεδομένα από το STRING (CC BY 4.0).
api.oanor.com/stringdb-api
API Polyγονικών Βαθμολογιών
Πολυγονικές (επικινδυνότητας) βαθμολογίες ως API — υποστηριζόμενες από το NHGRI-EBI PGS Catalog, την ανοιχτή βάση δεδομένων δημοσιευμένων πολυγονικών βαθμολογιών: σταθμισμένοι συνδυασμοί γενετικών παραλλαγών που χρησιμοποιούνται για την εκτίμηση της γενετικής προδιάθεσης ενός ατόμου σε ένα χαρακτηριστικό ή μια ασθένεια. Αναζητήστε χαρακτηριστικά με όνομα για να βρείτε τα αναγνωριστικά οντολογίας τους, καταγράψτε κάθε πολυγονική βαθμολογία που έχει αναπτυχθεί για ένα χαρακτηριστικό και διαβάστε τα πλήρη μεταδεδομένα μιας βαθμολογίας — τα αναφερόμενα και αντιστοιχισμένα (EFO/MONDO) χαρακτηριστικά, τον αριθμό των παραλλαγών στη βαθμολογία, τη μέθοδο ανάπτυξης, την έκδοση γονιδιώματος, την κατανομή καταγωγής των δειγμάτων στα οποία βασίστηκε και αξιολογήθηκε, τη δημοσίευση πίσω από αυτήν (τίτλος, περιοδικό, ημερομηνία, αναγνωριστικό PubMed), την ημερομηνία κυκλοφορίας, την άδεια χρήσης και έναν άμεσο σύνδεσμο προς το αρχείο βαθμολόγησης. Από τον καρκίνο του μαστού και τη στεφανιαία νόσο έως τον διαβήτη τύπου 2 και τον ΔΜΣ, είναι ιδανικό για στατιστική γενετική, γονιδιωματική, έρευνα πρόβλεψης κινδύνου και εργαλεία βιοπληροφορικής. Ένας πόρος πολυγονικής βαθμολογίας / γενετικής πρόβλεψης κινδύνου — διακριτός από μελέτες συσχέτισης μεμονωμένων παραλλαγών (GWAS Catalog), συχνότητες αλληλόμορφων πληθυσμού (gnomAD) και κλινική ερμηνεία παραλλαγών (ClinVar). Ανοιχτά δεδομένα από το NHGRI-EBI PGS Catalog (CC BY 4.0).
api.oanor.com/pgs-api
Συχνές ερωτήσεις
Γρήγορες απαντήσεις για τιμές, ποσοστώσεις και ενσωμάτωση.
Πώς αποκτώ ένα κλειδί API για το API Δομικών Παραλλαγών;
Ποιο είναι το όριο ρυθμού του API Δομικών Παραλλαγών;
Πόσο κοστίζει το API Δομικών Παραλλαγών;
Μπορώ να ακυρώσω τη συνδρομή μου ανά πάσα στιγμή;
Είναι το API Δομικών Παραλλαγών συμβατό με τον GDPR;
Επιλέξτε ένα τελικό σημείο από τη λίστα στα αριστερά για να δείτε τις λεπτομέρειες και δοκιμάστε το.
Αποσπάσματα κώδικα
Εγγραφείτε για να λάβετε ένα API key και, στη συνέχεια, καλέστε οποιαδήποτε διαδρομή κάτω από το slug σας.
curl https://api.oanor.com/dbvar-api/SOME_PATH \
-H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/dbvar-api/SOME_PATH", {
headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/dbvar-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
"https://api.oanor.com/dbvar-api/SOME_PATH",
headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())
Αξιολογήσεις
Συνδεθείτε για να βαθμολογήσετε.
Δεν υπάρχουν ακόμη κριτικές.
Συζήτηση
Κάνε ερωτήσεις, μοιράσου συμβουλές, πάρε απαντήσεις από τον πάροχο και άλλους προγραμματιστές. Δημόσιο — όλοι μπορούν να διαβάσουν.
Συνδέσου για να γράψεις ή να απαντήσεις.
ΣύνδεσηΝέα συζήτηση
·
-
Απάντηση παρόχου
🔒 Η συζήτηση είναι κλειδωμένη — δεν επιτρέπονται νέες απαντήσεις.
-
·
- Δεν υπάρχουν συζητήσεις — ξεκίνα την πρώτη.
Υποστήριξη
Ιδιωτική υποστήριξη 1:1 με τον πάροχο — χρέωση, ενσωμάτωση, λογαριασμός. Μόνο εσύ και η ομάδα του παρόχου βλέπετε αυτά τα threads.
Συνδέσου για να ανοίξεις ticket υποστήριξης.
ΣύνδεσηΆνοιγμα νέου ticket
Περιέγραψε με τι χρειάζεσαι βοήθεια. Η ομάδα λαμβάνει email και απαντά στη σελίδα του ticket.
-
·
Επείγουσα - Δεν υπάρχουν tickets για αυτό το API.