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API · /pride-api

API PRIDE

saludable 4,443 Suscriptoras

El archivo de proteómica PRIDE como una API, impulsado por el Archivo PRIDE de EMBL-EBI, el repositorio público más grande del mundo de datos de proteómica por espectrometría de masas y miembro fundador de ProteomeXchange. Busque experimentos públicos de proteómica por palabra clave (devolviendo el acceso, título, organismos, enfermedades e instrumentos de cada proyecto); lea los metadatos completos de un proyecto, incluida su descripción, palabras clave, organismos y partes de organismos, instrumentos de espectrometría de masas, software, las modificaciones de proteínas identificadas, protocolos de procesamiento de muestras y datos, remitentes, afiliaciones y la publicación vinculada (DOI y PubMed); enumere los archivos de datos de un proyecto con su categoría, formato, tamaño y un enlace de descarga directa; y explore facetas (las enfermedades, organismos, instrumentos, tipos de experimento, software y países representados en los proyectos coincidentes) para el descubrimiento. Ideal para investigación en proteómica y biología de sistemas, reutilización de conjuntos de datos y metaanálisis, tuberías de bioinformática y herramientas que integran evidencia experimental. Los accesos de proyecto tienen el formato PXD000001. Datos de EMBL-EBI.

#pride #proteomics #mass-spectrometry #datasets #proteomexchange #bioinformatics #life-sciences
api.oanor.com/pride-api
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Especificaciones legibles por máquina para que los agentes de IA puedan integrar este API.

/api/pride-api/openapi.json
/api/pride-api/llms.txt

Descubrimiento: GET /api/index.json enumera todos los API.

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saludable
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Starter

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  • Límite máximo (429 por encima de la cuota, sin excedente)
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Otros APIs con etiquetas superpuestas.

API de UniProt

La base de conocimiento de proteínas UniProt como API, impulsada por el servicio REST oficial de UniProt curado por EMBL-EBI, SIB y PIR. Busque cualquier proteína por su acceso UniProt para nombres de proteínas y genes, organismo, longitud, masa, función, palabras clave, términos de Gene Ontology (GO) y estructuras 3D de PDB vinculadas; realice búsquedas de texto completo de proteínas filtradas por organismo (ID de taxón NCBI) y estado de revisión Swiss-Prot; obtenga secuencias de aminoácidos con FASTA, peso molecular y suma de verificación CRC64; enumere características de secuencia como péptidos señal, cadenas, dominios, sitios activos y de unión, residuos modificados y variantes naturales, con un desglose por tipo; resuelva nodos de taxonomía NCBI con su linaje completo; y extraiga proteomas de referencia con recuentos de proteínas e IDs de ensamblaje del genoma. En todos los reinos de la vida, desde humanos hasta bacterias. Ideal para tuberías de bioinformática, herramientas de descubrimiento de fármacos y proteómica, paneles de análisis de secuencias, aplicaciones de investigación académica y chatbots de ciencias de la vida.

api.oanor.com/uniprot-api

API de MetaboLights

MetaboLights como API, impulsado por EMBL-EBI — el repositorio abierto más importante del mundo para experimentos de metabolómica (espectroscopia de RMN y espectrometría de masas) y un recurso hermano de PRIDE para proteómica. Busque estudios públicos de metabolómica por palabra clave (devolviendo el acceso, título, descripción y organismo de cada estudio); lea los metadatos completos de un estudio, incluido su resumen, estado, fechas de envío y publicación, descriptores de diseño del estudio, factores experimentales, los ensayos analíticos con su tipo de medición, tecnología y plataforma, los contribuyentes y sus roles, las publicaciones vinculadas con DOI e identificadores de PubMed, remitentes, recuento de muestras, URL de descarga FTP y licencia de datos; inspeccione el flujo de trabajo analítico — cada protocolo con su nombre, tipo, descripción y parámetros (recolección de muestras, extracción, cromatografía, espectroscopia de RMN/MS, transformación de datos e identificación de metabolitos); y enumere los organismos y partes de organismos estudiados con sus términos de ontología. Ideal para investigación en metabolómica y biología de sistemas, reutilización de conjuntos de datos y metaanálisis, tuberías de bioinformática y herramientas que integran evidencia experimental. Los accesos de estudio se ven como MTBLS1. Datos de EMBL-EBI MetaboLights.

api.oanor.com/metabolights-api

API de Expresión Génica

Experimentos de genómica funcional como una API — impulsada por NCBI GEO (Gene Expression Omnibus), el repositorio público más grande de datos de expresión génica. GEO archiva series de expresión y conjuntos de datos curados de experimentos de microarreglos y secuenciación de alto rendimiento en todos los organismos. Busque experimentos por palabra clave y opcionalmente por organismo, y consulte cualquier serie o conjunto de datos para obtener sus metadatos: título, resumen, tipo de ensayo (perfil de expresión por microarreglo o por secuenciación), organismo, número de muestras, plataforma y la publicación detrás de él. Desde estudios de estrés de células β hasta transcriptómica del cáncer en humanos y ratones, convierte el archivo GEO en una API simple de búsqueda y obtención para transcriptómica, bioinformática y descubrimiento de datos de investigación. Un repositorio de conjuntos de datos de expresión génica / genómica funcional — distinto de las bases de datos de secuencia (ENA), variantes (ClinVar, dbVar), estructura (PDB) y ontología. Datos abiertos de NCBI GEO (dominio público).

api.oanor.com/geodatasets-api

API de DataCite

DataCite como API: el registro global de DOIs (Identificadores de Objetos Digitales) para resultados de investigación. Mientras que Crossref registra DOIs para artículos de revistas, DataCite registra y describe DOIs para datos de investigación, software, muestras, disertaciones, preprints, modelos, imágenes y otros resultados, de repositorios como Zenodo, Dryad y miles de instituciones. /v1/search?query=climate realiza búsquedas de texto completo en el registro y se puede acotar por tipo de recurso (type=dataset, software, text, image, audiovisual, collection, model y más), devolviendo cada DOI con su título, tipo, creadores, editorial y año de publicación. /v1/doi?id=10.5281/zenodo.3509134 devuelve los metadatos completos de un solo DOI: título, tipo de recurso, creadores, editorial, año de publicación, descripción, materias, versión, licencia y fecha de registro. Los DOIs se ven como 10.5281/zenodo.3509134 (Zenodo) o 10.5061/dryad.xxxx (Dryad). Ideal para herramientas de descubrimiento y citación de datos de investigación, repositorios de datos y gestión de referencias, funciones de citación de software y flujos de trabajo de reproducibilidad. Los metadatos son CC0 de DataCite. Este es el registro de DOIs de datos de investigación y software, distinto del índice de DOIs de artículos de revistas (Crossref) y de servicios de preprints y acceso abierto.

api.oanor.com/datacite-api

Preguntas frecuentes

Respuestas rápidas sobre precios, cuotas e integración.

¿Cómo obtengo una clave API para API PRIDE?
Regístrate gratis en oanor.com, genera una clave API desde el panel de desarrollador y llama a API PRIDE con la cabecera x-oanor-key. No se necesita tarjeta de crédito para el plan gratuito.
¿Cuál es el límite de velocidad de API PRIDE?
El plan gratuito permite 1 solicitud por segundo. Los planes de pago escalan hasta 50 solicitudes por segundo en el nivel Mega. Los límites rígidos devuelven HTTP 429 por encima de la cuota — sin cargos sorpresa por exceso.
¿Cuánto cuesta API PRIDE?
API PRIDE ofrece un plan gratuito con 100 llamadas / mes. Los planes de pago empiezan en €6.60 / mes con cuotas más altas y límites de tasa más rápidos.
¿Puedo cancelar mi suscripción en cualquier momento?
Sí. Los planes se facturan mensualmente y puedes cancelar en cualquier momento desde el panel de facturación. Sin contratos a largo plazo ni penalización por cancelación.
¿Cumple API PRIDE con el RGPD?
Todas las solicitudes a API PRIDE pasan por nuestra pasarela en la UE. Tu clave API upstream nunca sale de nuestro servidor y no se comparten datos personales con el proveedor upstream más allá de la solicitud enviada.

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Fragmentos de código

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curl https://api.oanor.com/pride-api/SOME_PATH \
  -H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/pride-api/SOME_PATH", {
  headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/pride-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
    "https://api.oanor.com/pride-api/SOME_PATH",
    headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())

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