oanor
Iscriviti gratis
Mercata Prezzi Caratteristiche Accedi

API · /biosamples-api

BioSamples API

salutare 4,634 Abbonati

BioSamples como API, impulsado por EMBL-EBI — la base de datos que almacena y vincula los metadatos de muestras biológicas, los especímenes físicos detrás de los experimentos biológicos. Una muestra en BioSamples lleva un acceso estable (como SAMEA3231268) y un rico conjunto de características — organismo, tejido o parte del organismo, tipo celular, sexo, enfermedad, etapa de desarrollo, cepa y cualquier atributo proporcionado por el remitente — y es referenciada por otros archivos de EBI, incluidos el Archivo Europeo de Nucleótidos (ENA), ArrayExpress y PRIDE. /v1/search?q=liver busca muestras por texto libre y devuelve el acceso, nombre, organismo y fecha de publicación de cada coincidencia. /v1/sample?id=SAMEA3231268 devuelve los metadatos de una muestra — su acceso, nombre, ID de taxón NCBI, organismo, fechas de publicación y actualización, el número de relaciones con otras muestras, y sus características aplanadas en un mapa limpio clave→valor. Los accesos tienen el formato SAMEA…, SAMN… o SAMD…; obtenga uno desde el endpoint de búsqueda. Ideal para integración de datos en ciencias de la vida, seguimiento de muestras, armonización de metadatos y vinculación de datos de secuenciación o expresión con su espécimen fuente. Datos de EMBL-EBI BioSamples (público). Este es un registro de metadatos de muestras biológicas — distinto de las bases de datos de estudios (BioStudies), secuencias (ENA), variantes (ClinVar) y estructuras.

#biosamples #samples #embl-ebi #metadata #life-sciences #specimens #bioinformatics
api.oanor.com/biosamples-api
Ottieni una chiave API Prova nel parco giochi → Contatta provider

Specifica leggibile dalle macchine, così gli agenti AI possono integrare questa API.

/api/biosamples-api/openapi.json
/api/biosamples-api/llms.txt

Individuazione: GET /api/index.json elenca ogni API.

API salute

salutare
Tempo di attività
100.00%
Sondaggi del server · 24 ore su 24
Latenza media
364 ms
Sondaggi del server · 24 ore su 24
Abbonati
4,634
attiva
Chiamate totali
6
ultimi 7 giorni
status Pagina di stato completa → · 9 sonde/24h

Prezzi

Scegli un livello: fatturazione mensile, annullamento in qualsiasi momento.

Free

Gratis

  • 2,050 chiamate/mese
  • 2 richieste/secondo
  • Tetto rigido (429 sopra la quota, nessuna eccedenza)
  • 2050 calls/month
  • 2 req/sec
  • Search & sample metadata
  • No credit card
Accedi per abbonarti

Starter

€6.00 /mese

  • 46,000 chiamate/mese
  • 5 richieste/secondo
  • Tetto rigido (429 sopra la quota, nessuna eccedenza)
  • 46k calls/month
  • 5 req/sec
  • Characteristics map
  • Email support
Accedi per abbonarti

Pro

€18.50 /mese

  • 211,000 chiamate/mese
  • 12 richieste/secondo
  • Tetto rigido (429 sopra la quota, nessuna eccedenza)
  • 211k llamadas/mes
  • 12 req/seg
  • Integración de metadatos
  • Soporte prioritario
Accedi per abbonarti

Mega

€51.00 /mese

  • 772,000 chiamate/mese
  • 35 richieste/secondo
  • Tetto rigido (429 sopra la quota, nessuna eccedenza)
  • 772k calls/month
  • 35 req/sec
  • High-throughput life sciences
  • Dedicated SLA
Accedi per abbonarti

Costruito da

P
PremiumApi

Correlato APIs

Altro APIs con tag sovrapposti.

BioStudies API

BioStudies as an API, powered by EMBL-EBI — the database that holds the descriptions of biological studies and links their data together across EBI resources, including imaging (BioImage Archive), functional genomics (ArrayExpress), proteomics, and the literature (Europe PMC). Each study has an accession, a title and abstract, the collection it belongs to and links to its underlying data and publications. /v1/search?query=covid searches the studies and returns each match's accession (e.g. S-EPMC8017430), title, author, study type, release date and link/file counts. /v1/study?id=S-EPMC8017430 returns a study's metadata — its accession, the collection it belongs to (such as EuropePMC, ArrayExpress or BioImages), title, abstract, release date, authors and the number of linked resources. Accessions look like S-EPMC8017430 or S-BSST123; get one from the search endpoint. Ideal for research-data discovery, linking literature to its underlying datasets, systematic reviews and reproducibility tooling. Data from EMBL-EBI BioStudies (public). This is a studies and datasets metadata index — distinct from the sequence (UniProt, ENA), structure (PDB, EMDB), variant (ClinVar) and ontology databases.

api.oanor.com/biostudies-api

EMDB API

The Electron Microscopy Data Bank (EMDB) as an API, powered by EMBL-EBI — the public archive of three-dimensional electron-microscopy density maps of proteins, nucleic acids and large macromolecular complexes. EMDB is the electron-microscopy counterpart of the Protein Data Bank, holding maps solved by single-particle cryo-EM, electron tomography and electron crystallography, the technique behind the recent "resolution revolution" in structural biology. /v1/search?q=ribosome searches the archive and returns each matching entry's EMDB id (e.g. EMD-1010), title, electron-microscopy method and resolution in ångström. /v1/entry?id=EMD-1010 returns an entry's metadata — its title, the EM method (single particle, tomography, …), the aggregation state, the resolution, the biological sample studied, classification keywords, the deposition, map-release and last-update dates, and the depositing authors. EMDB ids look like EMD-1010, and you may pass just the number. Ideal for structural-biology and cryo-EM tools, structure-comparison and visualisation apps, and education. Data from EMBL-EBI EMDB (public domain). This is the archive of experimental electron-microscopy MAPS — distinct from atomic-coordinate structures (the PDB), predicted structures (AlphaFold) and protein-sequence databases (UniProt).

api.oanor.com/emdb-api

BioModels API

BioModels como API, impulsado por EMBL-EBI — el repositorio más grande del mundo de modelos matemáticos curados y publicados de sistemas biológicos. BioModels recopila modelos computacionales (principalmente en SBML, el Lenguaje de Marcado de Biología de Sistemas) de metabolismo, señalización celular, redes de regulación genética, ciclo celular, procesos de enfermedades y fisiología, cada uno vinculado a la publicación revisada por pares de la que proviene. /v1/search?query=glycolysis busca en el repositorio y devuelve el id de cada modelo coincidente (como BIOMD0000000012), nombre, formato, remitente y fechas de envío/modificación. /v1/model?id=BIOMD0000000012 devuelve los metadatos de un modelo: su nombre y descripción, el formato de codificación, el enfoque de modelado (por ejemplo, modelo de ecuaciones diferenciales ordinarias), el estado de curación, la publicación detrás (título, revista, año, autores) y los archivos del modelo. Los ids de modelo se ven como BIOMD0000000012 para modelos curados o MODEL1234567890 para envíos no curados; obténgalos del endpoint de búsqueda. Ideal para herramientas de biología de sistemas y modelado computacional, flujos de trabajo de investigación reproducible y reutilización de modelos, y enseñanza. Datos de EMBL-EBI BioModels (CC0). Este es un repositorio de modelos computacionales / biología de sistemas — distinto de las bases de datos de secuencias (UniProt, ENA), estructuras (PDB, AlphaFold), rutas y variantes (ClinVar).

api.oanor.com/biomodels-api

OLS Ontology API

EMBL-EBI Ontology Lookup Service (OLS) jako API — jeden punkt dostępu do ponad 280 biomedycznych i naukowych ontologii oraz kontrolowanych słowników w jednym miejscu: Gene Ontology (GO), Human Disease Ontology (DOID), Human Phenotype Ontology (HP), ChEBI (jednostki chemiczne), Uberon (anatomia), Experimental Factor Ontology (EFO), Mondo, NCIt i wiele innych. /v1/search?q=diabetes wyszukuje terminy we wszystkich ontologiach (lub ogranicza do jednej za pomocą ontology=doid), zwracając etykietę, identyfikator OBO (np. DOID:9351 lub GO:0008150), ontologię, IRI oraz krótką definicję każdego dopasowania. /v1/term?ontology=doid&id=DOID:9351 zwraca szczegóły pojedynczego terminu — jego etykietę, definicję, IRI, synonimy oraz informację, czy jest przestarzały. /v1/ontologies przegląda dostępne ontologie z ich identyfikatorem, tytułem, opisem i liczbą terminów. Identyfikatory OBO wyglądają jak DOID:9351, GO:0008150, HP:0000118 lub CHEBI:15377. Idealne do biomedycznego przetwarzania języka naturalnego, adnotacji i harmonizacji danych, autouzupełniania terminologii naukowej oraz narzędzi semantycznych i grafów wiedzy. Dane z EMBL-EBI OLS (otwarte). Jest to ogólne wyszukiwanie ontologii/kontrolowanych słowników obejmujące wiele dziedzin — szersze niż pojedynczy tezaurus medyczny, taki jak MeSH.

api.oanor.com/ols-api

Domande frequenti

Risposte rapide su prezzi, quote e integrazione.

Come ottengo una chiave API per BioSamples API?
Registrati gratuitamente su oanor.com, genera una chiave API dalla dashboard sviluppatore e chiama BioSamples API con l'header x-oanor-key. Nessuna carta di credito richiesta per il piano gratuito.
Qual è il limite di velocità di BioSamples API?
Il piano gratuito consente 1 richiesta al secondo. I piani a pagamento arrivano fino a 50 richieste al secondo nel piano Mega. I limiti rigorosi restituiscono HTTP 429 oltre la quota — nessuna spesa imprevista.
Quanto costa BioSamples API?
BioSamples API ha un piano gratuito con 100 chiamate / mese. I piani a pagamento partono da €6.00 / mese con quote più alte e limiti di velocità più rapidi.
Posso cancellare l'abbonamento in qualsiasi momento?
Sì. I piani sono fatturati mensilmente e puoi cancellare in qualsiasi momento dalla dashboard di fatturazione. Nessun contratto a lungo termine e nessuna penale di cancellazione.
BioSamples API è conforme al GDPR?
Tutte le richieste a BioSamples API passano attraverso il nostro gateway in UE. La tua chiave upstream non lascia mai il nostro server e nessun dato personale viene condiviso con il fornitore upstream oltre alla richiesta inviata.

Scegli un endpoint dall'elenco a sinistra per visualizzarne i dettagli e provarlo.

Frammenti di codice

Iscriviti per ottenere una chiave API, quindi chiama qualsiasi percorso sotto il tuo slug.

curl https://api.oanor.com/biosamples-api/SOME_PATH \
  -H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/biosamples-api/SOME_PATH", {
  headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/biosamples-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
    "https://api.oanor.com/biosamples-api/SOME_PATH",
    headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())

Valutazioni

Accedi per votare.

Nessuna recensione ancora.

Discussione

Fai domande, condividi consigli, ricevi risposte dal provider e dagli altri sviluppatori. Pubblico — chiunque può leggere.

Accedi per scrivere o rispondere.

Accedi

Nuova discussione

/ 4000

📌 Fissato 🔒 Bloccato

·

· ·

/ 4000

🔒 Discussione bloccata — non si può più rispondere.

  • Nessuna discussione — inizia tu.

Supporto

Supporto privato 1:1 con il provider — fatturazione, integrazione, account. Solo tu e il team del provider vedete questi thread.

Accedi per aprire un ticket di supporto.

Accedi

Apri nuovo ticket

Descrivi cosa ti serve. Il team del provider riceve un'email e risponde sulla pagina del ticket.

  • Nessun ticket per questa API.

Abbonamento attivo: le chiamate possono iniziare subito.

Invia la tua prima richiesta —

Abbonamento attivo: copia uno snippet e avvia la tua prima chiamata.