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API Gene Ontology

Fonction des gènes sous forme d'API — propulsée par QuickGO d'EMBL-EBI et l'Ontologie des Gènes (GO), le vocabulaire standard qui décrit ce que font les produits des gènes selon trois aspects : fonction moléculaire, processus biologique et composant cellulaire. Étant donné un gène ou une protéine (un identifiant UniProt), lister chaque annotation GO qui lui est attribuée — le terme GO, son aspect, le qualificatif, le code de preuve, la référence justificative (par exemple un identifiant PubMed), l'organisme et qui l'a assignée — éventuellement filtré par aspect ou organisme. Consulter n'importe quel terme GO pour obtenir sa définition, son aspect, ses synonymes et le nombre de termes enfants ; et rechercher l'ontologie par nom pour trouver les termes GO appropriés. Les noms des termes GO sont résolus automatiquement sur les annotations. De TP53 à n'importe quelle protéine de n'importe quelle espèce, c'est l'épine dorsale de la génomique fonctionnelle — idéal pour l'analyse d'enrichissement, les pipelines d'annotation, la bioinformatique et les outils de recherche. Une ressource d'annotation de fonction des gènes (quels gènes ont quelles fonctions, avec preuves) — distincte de la consultation générique de termes d'ontologie. Données ouvertes provenant de QuickGO d'EMBL-EBI et du Consortium GO (CC BY 4.0).