GO annotations for a gene/protein
API · /quickgo-api
Gene Ontology API
gesund
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Genfunktion als API – betrieben durch EMBL-EBIs QuickGO und die Gene Ontology (GO), das Standardvokabular, das beschreibt, was Genprodukte in drei Aspekten tun: molekulare Funktion, biologischer Prozess und zelluläre Komponente. Geben Sie ein Gen oder Protein (eine UniProt-Zugangsnummer) an, listen Sie jede GO-Annotation auf, die dafür erstellt wurde – den GO-Term, seinen Aspekt, den Qualifier, den Evidenzcode, die unterstützende Referenz (z. B. eine PubMed-ID), den Organismus und wer sie zugewiesen hat – optional gefiltert nach Aspekt oder Organismus. Schlagen Sie jeden GO-Term nach, um seine Definition, seinen Aspekt, Synonyme und die Anzahl der Kindterme zu erhalten; und durchsuchen Sie die Ontologie nach Namen, um die richtigen GO-Terme zu finden. GO-Termnamen werden bei Annotationen automatisch aufgelöst. Von TP53 bis zu jedem Protein in jeder Spezies ist es das Rückgrat der funktionellen Genomik – ideal für Anreicherungsanalysen, Annotationspipelines, Bioinformatik und Forschungswerkzeuge. Eine Genfunktions-Annotationsressource (welche Gene welche Funktionen haben, mit Evidenz) – unterschieden von generischer Ontologie-Term-Suche. Offene Daten von EMBL-EBI QuickGO und dem GO Consortium (CC BY 4.0).
api.oanor.com/quickgo-api
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OLS Ontology API
Der EMBL-EBI Ontology Lookup Service (OLS) als API – ein zentraler Zugangspunkt zu mehr als 280 biomedizinischen und wissenschaftlichen Ontologien und kontrollierten Vokabularen an einem Ort: der Gene Ontology (GO), der Human Disease Ontology (DOID), der Human Phenotype Ontology (HP), ChEBI (chemische Entitäten), Uberon (Anatomie), der Experimental Factor Ontology (EFO), Mondo, NCIt und vielen weiteren. /v1/search?q=diabetes durchsucht Begriffe in allen Ontologien (oder beschränkt auf eine mit ontology=doid) und gibt für jeden Treffer die Bezeichnung, die OBO-ID (wie DOID:9351 oder GO:0008150), die Ontologie, die IRI und eine kurze Definition zurück. /v1/term?ontology=doid&id=DOID:9351 gibt die Details eines einzelnen Begriffs zurück – seine Bezeichnung, Definition, IRI, Synonyme und ob er veraltet ist. /v1/ontologies listet die verfügbaren Ontologien mit ihrer ID, ihrem Titel, ihrer Beschreibung und der Anzahl der Begriffe auf. OBO-IDs sehen aus wie DOID:9351, GO:0008150, HP:0000118 oder CHEBI:15377. Ideal für biomedizinische Verarbeitung natürlicher Sprache, Datenannotation und -harmonisierung, Autovervollständigung über wissenschaftliche Terminologie sowie semantische und Wissensgraph-Werkzeuge. Daten von EMBL-EBI OLS (offen). Dies ist eine allgemeine Ontologie-/kontrollierte Vokabular-Suche, die viele Bereiche abdeckt – breiter als ein einzelner medizinischer Thesaurus wie MeSH.
api.oanor.com/ols-api
Ontology API
Biomedizinische Ontologien als API, unterstützt durch den EBI Ontology Lookup Service (OLS). Durchsuchen Sie über 280 kuratierte Ontologien — Krankheiten (MONDO), menschliche Phänotypen (HP), die Gene Ontology (GO), Anatomie (UBERON), Zelltypen (CL), Chemie (ChEBI), experimentelle Faktoren (EFO), den NCI Thesaurus und viele mehr — um Begriffe nach Namen zu finden; durchstöbern Sie den vollständigen Ontologiekatalog mit Versionen und Begriffszahlen; lesen Sie jeden Begriff für seine Definition, exakte Synonyme, OBO-ID, IRI und Veraltungsstatus; und durchlaufen Sie die Klassenhierarchie über die direkten Eltern- und Kindknoten eines Begriffs. Ideal für klinische Datenharmonisierung und -kodierung, biomedizinische Suche und Autovervollständigung, Wissensgraphenanreicherung, Annotation und Kuratierungspipelines sowie Forschungs- und EHR-Anwendungen, die standardisierte Vokabulare benötigen. OBO-IDs sehen aus wie MONDO:0005148 oder GO:0008150.
api.oanor.com/ontology-api
Genome Assemblies API
Referenz-Genomassemblies als API – unterstützt durch NCBI Assembly, das Register der Genombuilds für Organismen im gesamten Baum des Lebens. Durchsuchen Sie Assemblies nach Organismus (oder Freitext) und rufen Sie die Metadaten jedes Assemblies ab: seine Accession (GCF_… RefSeq oder GCA_… GenBank), Name (z. B. GRCh38.p14), Organismus und Taxon-ID, Assembly-Level (vollständiges Genom, Chromosom, Scaffold oder Contig), Kontiguitätsstatistiken (Contig- und Scaffold-N50), Sequenzierungsabdeckung, RefSeq-Kategorie, UCSC- und Ensembl-Namen, die einreichende Organisation, Veröffentlichungsdatum und FTP-Download-Pfade. Vom menschlichen Referenzgenom bis zu jedem sequenzierten Mikroben, Pflanze oder Tier verwandelt es das Genom-Assembly-Register in eine saubere Such- und Abruf-API. Ein Genom-Assembly-Register – unterschieden von Sequenz- (ENA), Genomannotation- (Ensembl), Varianten- (ClinVar, dbVar) und Genexpressionsdatenbanken (GEO). Offene Daten von NCBI Assembly (Public Domain).
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Gene Expression API
Funktionelle Genomik-Experimente als API — unterstützt von NCBI GEO (Gene Expression Omnibus), dem größten öffentlichen Repository für Genexpressionsdaten. GEO archiviert Expressionsserien und kuratierte Datensätze aus Microarray- und Hochdurchsatz-Sequenzierungsexperimenten aller Organismen. Durchsuchen Sie Experimente nach Stichwort und optional nach Organismus, und rufen Sie jede Serie oder jeden Datensatz ab, um deren Metadaten zu erhalten: Titel, Zusammenfassung, Assay-Typ (Expressionsprofilierung durch Array oder durch Sequenzierung), Organismus, Anzahl der Proben, Plattform und die zugrunde liegende Publikation. Von β-Zell-Stress-Studien bis hin zur Krebs-Transkriptomik bei Mensch und Maus verwandelt es das GEO-Archiv in eine einfache Such- und Abruf-API für Transkriptomik, Bioinformatik und Forschungsdaten-Entdeckung. Ein Repository für Genexpressions-/funktionelle Genomik-Datensätze — abgegrenzt von Sequenz- (ENA), Varianten- (ClinVar, dbVar), Struktur- (PDB) und Ontologie-Datenbanken. Offene Daten von NCBI GEO (Public Domain).
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Häufig gestellte Fragen
Schnelle Antworten zu Preisen, Kontingenten und Integration.
Wie bekomme ich einen API-Key für Gene Ontology API?
Registriere dich kostenlos auf oanor.com, erstelle einen API-Key im Entwickler-Dashboard und rufe Gene Ontology API mit dem x-oanor-key-Header auf. Keine Kreditkarte für den Free-Tier nötig.
Wie hoch ist das Rate-Limit für Gene Ontology API?
Der Free-Tier erlaubt 1 Anfrage pro Sekunde. Bezahlte Pläne skalieren bis zu 50 Anfragen pro Sekunde im Mega-Tier. Harte Limits liefern HTTP 429 oberhalb der Quote — keine überraschenden Mehrkosten.
Was kostet Gene Ontology API?
Gene Ontology API hat einen Free-Tier mit 100 Calls / Monat. Bezahlte Pläne starten bei €7.30 / Monat mit höheren Kontingenten und schnelleren Rate-Limits.
Kann ich mein Abo jederzeit kündigen?
Ja. Pläne werden monatlich abgerechnet und du kannst jederzeit in deinem Billing-Dashboard kündigen. Keine Mindestlaufzeit und keine Kündigungsgebühr.
Ist Gene Ontology API DSGVO-konform?
Alle Anfragen an Gene Ontology API laufen über unser EU-Gateway. Dein Upstream-API-Key verlässt nie unseren Server und es werden keine personenbezogenen Daten an den Upstream-Anbieter weitergegeben außer der Anfrage selbst.
Wähle einen Endpoint aus der Liste links — Details und Playground erscheinen hier.
Code-Snippets
Registrieren, um einen API-Key zu bekommen, dann jeden Pfad unter deinem Slug aufrufen.
curl https://api.oanor.com/quickgo-api/SOME_PATH \
-H "x-oanor-key: oanor_test_..."const res = await fetch("https://api.oanor.com/quickgo-api/SOME_PATH", {
headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();$ch = curl_init("https://api.oanor.com/quickgo-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);import requests
r = requests.get(
"https://api.oanor.com/quickgo-api/SOME_PATH",
headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())Bewertungen
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