oanor
Gratis registreren
Marktplaats Prijzen Functies Inloggen

API · /biostudies-api

BioStudies API

gezond 3,872 Abonnees

BioStudies als API, aangedreven door EMBL-EBI — de database die de beschrijvingen van biologische studies bevat en hun gegevens verbindt over EBI-bronnen heen, waaronder beeldvorming (BioImage Archive), functionele genomica (ArrayExpress), proteomics en de literatuur (Europe PMC). Elke studie heeft een accession, een titel en samenvatting, de collectie waartoe het behoort en links naar de onderliggende gegevens en publicaties. /v1/search?query=covid doorzoekt de studies en retourneert de accession (bijv. S-EPMC8017430), titel, auteur, studietype, releasedatum en link/bestandtellingen van elke overeenkomst. /v1/study?id=S-EPMC8017430 retourneert de metadata van een studie — de accession, de collectie waartoe het behoort (zoals EuropePMC, ArrayExpress of BioImages), titel, samenvatting, releasedatum, auteurs en het aantal gekoppelde bronnen. Accessions zien eruit als S-EPMC8017430 of S-BSST123; haal er een uit het zoekendpoint. Ideaal voor onderzoeksgegevensontdekking, het koppelen van literatuur aan de onderliggende datasets, systematische reviews en reproduceerbaarheidstools. Gegevens van EMBL-EBI BioStudies (openbaar). Dit is een index van studies en datasets metadata — verschillend van de sequentie- (UniProt, ENA), structuur- (PDB, EMDB), variant- (ClinVar) en ontologiedatabases.

#biostudies #research-data #embl-ebi #datasets #life-sciences #metadata #bioinformatics
api.oanor.com/biostudies-api
Verkrijg een API-sleutel Probeer het in de speeltuin → Provider contacteren

Machineleesbare specificaties zodat AI-agenten deze API kunnen integreren.

/api/biostudies-api/openapi.json
/api/biostudies-api/llms.txt

Ontdekking: GET /api/index.json vermeldt elke API.

API-gezondheid

gezond
Uptime
100.00%
Serversondes · 24 uur
Gem. latentie
298 ms
Serversondes · 24 uur
Abonnees
3,872
actief
Totaal aantal oproepen
6
laatste 7 dagen
status Volledige statuspagina → · 9 sondes/24u

Prijzen

Kies een niveau: maandelijks gefactureerd en op elk gewenst moment opzegbaar.

Free

Vrij

  • 2,150 oproepen / maand
  • 2 verzoeken / tweede
  • Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
  • 2150 oproepen/maand
  • 2 verzoeken/sec
  • Zoek en bestudeer metadata
  • Geen creditcard
Meld u aan om u te abonneren

Starter

€6.00 /maand

  • 47,000 oproepen / maand
  • 5 verzoeken / tweede
  • Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
  • 47k oproepen/maand
  • 5 verzoeken/sec
  • Collecties & samenvattingen
  • E-mailondersteuning
Meld u aan om u te abonneren

Pro

€18.50 /maand

  • 212,000 oproepen / maand
  • 12 verzoeken / tweede
  • Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
  • 212k oproepen/maand
  • 12 verzoeken/sec
  • Gegevensontdekking en -koppeling
  • Prioritaire ondersteuning
Meld u aan om u te abonneren

Mega

€51.50 /maand

  • 775,000 oproepen / maand
  • 35 verzoeken / tweede
  • Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
  • 775k oproepen/maand
  • 35 verzoeken/sec
  • Onderzoeksgegevens met hoge doorvoer
  • Toegewijde SLA
Meld u aan om u te abonneren

Gebouwd door

P
PremiumApi

Gerelateerd APIs

Andere APIs met overlappende tags.

DataCite API

DataCite als API — het wereldwijde register van DOI's (Digital Object Identifiers) voor onderzoeksoutputs. Waar Crossref DOI's registreert voor tijdschriftartikelen, registreert en beschrijft DataCite DOI's voor onderzoeksdata, software, monsters, dissertaties, preprints, modellen, afbeeldingen en andere outputs, van repositories zoals Zenodo, Dryad en duizenden instellingen. /v1/search?query=climate doorzoekt het register op volledige tekst en kan worden verfijnd op brontype (type=dataset, software, text, image, audiovisual, collection, model en meer), waarbij elke DOI wordt geretourneerd met zijn titel, type, makers, uitgever en publicatiejaar. /v1/doi?id=10.5281/zenodo.3509134 retourneert de volledige metadata van een enkele DOI — titel, brontype, makers, uitgever, publicatiejaar, beschrijving, onderwerpen, versie, licentie en registratiedatum. DOI's zien eruit als 10.5281/zenodo.3509134 (Zenodo) of 10.5061/dryad.xxxx (Dryad). Ideaal voor het ontdekken en citeren van onderzoeksdata, tools voor datarepositories en referentiebeheer, softwarecitatie-functies en reproduceerbaarheidswerkstromen. Metadata is CC0 van DataCite. Dit is het register van onderzoeksdata en software-DOI's — te onderscheiden van de DOI-index voor tijdschriftartikelen (Crossref) en van preprint- en open-accessdiensten.

api.oanor.com/datacite-api

BioSamples API

BioSamples als API, aangedreven door EMBL-EBI — de database die de metadata van biologische monsters opslaat en koppelt, de fysieke specimens achter biologische experimenten. Een monster in BioSamples heeft een stabiele toegang (zoals SAMEA3231268) en een rijke set kenmerken — organisme, weefsel of orgaandeel, celtype, geslacht, ziekte, ontwikkelingsstadium, stam en alle door de indiener verstrekte attributen — en wordt gerefereerd door andere EBI-archieven, waaronder het European Nucleotide Archive (ENA), ArrayExpress en PRIDE. /v1/search?q=liver doorzoekt monsters op vrije tekst en retourneert de toegang, naam, organisme en releasedatum van elke overeenkomst. /v1/sample?id=SAMEA3231268 retourneert de metadata van een monster — de toegang, naam, NCBI-taxon-id, organisme, release- en updatedatums, het aantal relaties met andere monsters, en de kenmerken afgevlakt tot een schone sleutel→waarde-kaart. Toegangen zien eruit als SAMEA…, SAMN… of SAMD…; haal er een uit het zoekendpoint. Ideaal voor levenswetenschappelijke data-integratie, monstertracking, metadata-harmonisatie en het koppelen van sequencing- of expressiegegevens terug naar het oorspronkelijke specimen. Gegevens van EMBL-EBI BioSamples (openbaar). Dit is een biologisch-monster-metadataregister — te onderscheiden van studie- (BioStudies), sequentie- (ENA), variant- (ClinVar) en structuurdatabases.

api.oanor.com/biosamples-api

EMDB API

De Electron Microscopy Data Bank (EMDB) als API, aangedreven door EMBL-EBI — het openbare archief van driedimensionale elektronenmicroscopie-dichtheidskaarten van eiwitten, nucleïnezuren en grote macromoleculaire complexen. EMDB is de elektronenmicroscopie-tegenhanger van de Protein Data Bank, met kaarten opgelost door single-particle cryo-EM, elektronentomografie en elektronenkristallografie, de techniek achter de recente 'resolutie-revolutie' in de structurele biologie. /v1/search?q=ribosome doorzoekt het archief en retourneert voor elke overeenkomende vermelding de EMDB-id (bijv. EMD-1010), titel, elektronenmicroscopiemethode en resolutie in ångström. /v1/entry?id=EMD-1010 retourneert de metadata van een vermelding — de titel, de EM-methode (single particle, tomografie, …), de aggregatietoestand, de resolutie, het bestudeerde biologische monster, classificatie-sleutelwoorden, de datums van deponering, kaartpublicatie en laatste update, en de indienende auteurs. EMDB-ids zien eruit als EMD-1010, en u kunt alleen het nummer doorgeven. Ideaal voor structurele-biologie- en cryo-EM-tools, structuurvergelijking- en visualisatie-apps, en onderwijs. Gegevens van EMBL-EBI EMDB (publiek domein). Dit is het archief van experimentele elektronenmicroscopie-KAARTEN — te onderscheiden van atomaire-coördinaatstructuren (de PDB), voorspelde structuren (AlphaFold) en eiwitsequentiedatabases (UniProt).

api.oanor.com/emdb-api

BioModels API

BioModels als API, aangedreven door EMBL-EBI — 's werelds grootste repository van gecureerde, gepubliceerde wiskundige modellen van biologische systemen. BioModels verzamelt computationele modellen (meestal in SBML, de Systems Biology Markup Language) van metabolisme, celsignalering, genregulatienetwerken, de celcyclus, ziekteprocessen en fysiologie, elk gekoppeld aan de peer-reviewed publicatie waaruit het afkomstig is. /v1/search?query=glycolysis doorzoekt de repository en retourneert voor elk overeenkomend model de id (zoals BIOMD0000000012), naam, formaat, indiener en inzendings-/wijzigingsdatums. /v1/model?id=BIOMD0000000012 retourneert de metadata van een model — de naam en beschrijving, het coderingsformaat, de modelleringsaanpak (bijv. gewone differentiaalvergelijkingmodel), de curatiestatus, de publicatie erachter (titel, tijdschrift, jaar, auteurs) en de modelbestanden. Model-ID's zien eruit als BIOMD0000000012 voor gecureerde modellen of MODEL1234567890 voor niet-gecureerde inzendingen; haal ze op uit het zoekendpoint. Ideaal voor systeembiologie- en computationele modelleringstools, reproduceerbaar onderzoek en modelhergebruikworkflows, en onderwijs. Gegevens van EMBL-EBI BioModels (CC0). Dit is een systeembiologie-/computationeel-modelrepository — te onderscheiden van sequentie- (UniProt, ENA), structuur- (PDB, AlphaFold), pathway- en variantdatabases (ClinVar).

api.oanor.com/biomodels-api

Veelgestelde vragen

Snelle antwoorden over prijzen, quota's en integratie.

Hoe krijg ik een API-sleutel voor BioStudies API?
Registreer gratis op oanor.com, genereer een API-sleutel in het ontwikkelaarsdashboard en roep BioStudies API aan met de x-oanor-key-header. Geen creditcard nodig voor het gratis abonnement.
Wat is de rate-limit voor BioStudies API?
Het gratis pakket staat 1 verzoek per seconde toe. Betaalde pakketten schalen tot 50 verzoeken per seconde op het Mega-niveau. Harde limieten geven HTTP 429 boven de quota — geen verrassende meerkosten.
Wat kost BioStudies API?
BioStudies API heeft een gratis pakket met 100 calls / maand. Betaalde pakketten beginnen bij €6.00 / maand met hogere quota's en snellere rate-limits.
Kan ik mijn abonnement op elk moment opzeggen?
Ja. Abonnementen worden maandelijks gefactureerd en je kunt op elk moment opzeggen via je facturatie-dashboard. Geen langetermijncontracten en geen opzegkosten.
Voldoet BioStudies API aan de AVG?
Alle aanvragen aan BioStudies API lopen via onze EU-gateway. Je upstream-API-sleutel verlaat nooit onze server en er worden geen persoonsgegevens gedeeld met de upstream-leverancier behalve de aanvraag zelf.

Kies een eindpunt uit de lijst aan de linkerkant om de details ervan te bekijken en het te proberen.

Codefragmenten

Meld u aan om een ​​API-sleutel te krijgen en roep vervolgens een pad onder uw naaktslak aan.

curl https://api.oanor.com/biostudies-api/SOME_PATH \
  -H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/biostudies-api/SOME_PATH", {
  headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/biostudies-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
    "https://api.oanor.com/biostudies-api/SOME_PATH",
    headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())

Beoordelingen

Log in om te beoordelen.

Nog geen beoordelingen.

Discussie

Stel vragen, deel tips, krijg antwoorden van de aanbieder en andere ontwikkelaars. Openbaar — iedereen kan meelezen.

Meld je aan om te schrijven of te antwoorden.

Inloggen

Nieuwe discussie

/ 4000

📌 Vastgepind 🔒 Vergrendeld

·

· ·

/ 4000

🔒 Deze discussie is vergrendeld — geen nieuwe antwoorden.

  • Nog geen discussies — start de eerste.

Support

Privé 1:1-support met de aanbieder — facturatie, integratie, account. Alleen jij en het aanbiedersteam zien deze threads.

Meld je aan om een supportticket te openen.

Inloggen

Nieuw ticket openen

Beschrijf waar je hulp bij nodig hebt. Het team krijgt een mail en antwoordt op de ticketpagina.

  • Nog geen tickets voor deze API.

Abonnement actief: calls kunnen direct starten.

Verstuur uw eerste aanvraag —

Abonnement actief: kopieer een fragment en start uw eerste oproep.